その他

Qiitaで「実験屋のためのPython」というタグを使ってノウハウを共有しています。

解析関連

• 大量の実験データの測定条件管理と解析にpandas.DataFrameを活用する
• N行N列のnumpy arrayを扱う際に気をつけるべき方向と座標の定義
• pyFAIを使って二次元強度分布を一次元化する
• SciPyを使ってWigner-Seitz cellの体積を計算する (Voronoi図+Delaunay三角形分割あるいは凸包)
• Pythonを使ってDECTRISの二次元検出器のHDF5データを読み込む

可視化関連

• matplotlibを使って二次元検出器の二次元強度マップを作る
• matplotlibでcolor cycleのN番目の色を指定するいくつかの方法
• 早く知っておきたかったmatplotlibの基礎知識、あるいは見た目の調整が捗るArtistの話
• matplotlibのcolorbarを解剖してわかったこと、あるいはもうcolorbar調整に苦労したくない人に捧げる話

その他

• Pythonを使って固定視点画像からデジタル数字を抽出する
• Pythonを使いHDFファイルの階層構造を把握してデータを読み込む
• 画像のスムージングは確率密度の推定である

私は2012年から磁性材料の中性子回折データ解析のために主にFullProfを使ってきました。FullProfの公式マニュアルは2001年（！！）から更新されておらず、英語でさえも使用するにあたって必要な情報が充実しているとは言えません。ヨーロッパを中心に開催されている開発リーダーのJuan Rodríguez-Carvajalらによる関連セミナーやワークショップにおいて最新機能を使うための実践的な知識の伝達が行われていますが、既存機能を使う際に必要な細かいノウハウはおそらくユーザーコミュニティ内での直伝に頼っているのではないかと思います。マニュアルの充実したRietan-FPの牙城である日本ではFullProfユーザーは少数派であり、日本語で公開されている情報も非常に限定的で、ユーザーコミュニティ内での直伝はなかなか期待できません。ここでは私がここ数年で書きためたFullProfに関するメモを公開する予定です。本格的な磁気構造解析や結晶構造解析の必要のない系ばかり扱ってきたため、FullProf Suiteに付いている便利な諸機能については知りません。しかし、なんらかの理由でFullProfを使いたいが意味不明なエラーへの対処に困っている方には役に立つことが書いてあるかもしれません。

掲載予定内容

1. J-PARCのTOFデータをFullProfでリートベルト解析する
2. 磁気構造を入れる
3. 格子定数の温度依存性などを連続してリートベルト解析する (sequential refinement)
4. 単結晶回折データから構造精密化する
5. Simulated Annealing

掲載まで待てない、原因不明のエラーで困っているという方はメールで連絡をください。

• 第62回リンダウ会議参加報告 JSPSサイト PDF
• IUCr2014参加報告 PFニュース vol.32 No.3 PDF
• IUCr MaThCryst & CIMS Workshop参加報告 PFニュース vol.32 No.4 PDF
• SAS2015参加報告 PFニュース vol.33 No.3 PDF
• REPM2016参加報告 PFニュース vol.34 No.3 PDF