ศูนย์อนามัยที่ 6 ในฐานะเป็นหน่วยงานในสังกัดกรมอนามัย มีอำนาจหน้าที่ในการศึกษา วิจัย พัฒนาและบริการวิชาการเพื่อประยุกต์ใช้องค์ความรู้และเทคโนโลยีด้านการบริการ
ส่งเสริมสุขภาพ การจัดการอนามัยสิ่งแวดล้อม และการประเมินผลกระทบต่อสุขภาพในระดับพื้นที่ เพื่อให้เกิดความสอดคล้องเหมาะสมกับบริบทของท้องถิ่น และการเสริมสร้างศักยภาพ ขีดความสามารถและความเข้มแข็งให้แก่หน่วยงานส่วนภูมิภาค องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น และภาคีเครือข่ายที่เกี่ยวข้องทุกระดับในการส่งเสริมสุขภาพ การจัดการอนามัยสิ่งแวดล้อม
และการประเมินผลกระทบต่อสุขภาพในระดับพื้นที่ รวมถึงการรณรงค์ เผยแพร่ความรู้และเทคโนโลยีด้านบริการส่งเสริมสุขภาพและอนามัยสิ่งแวดล้อมแก่เครือข่ายประชาชนในระดับพื้นที่ที่รับผิดชอบ ดังนั้นผลงานวิจัย ผลงานวิชาการและนวัตกรรมจึงเป็นเครื่องมือที่สำคัญ
ในการสนับสนุนทางวิชาการเพื่อขับเคลื่อนการดำเนินงานด้านส่งเสริมสุขภาพและอนามัย
สิ่งแวดล้อมที่สามารถแก้ไขสถานการณ์ปัจจุบันและสอดคล้องกับแผนยุทธศาสตร์การพัฒนาระบบส่งเสริมสุขภาพและอนามัยสิ่งแวดล้อมฯ กรมอนามัย