โรงเรียนกันทรลักษ์ธรรมวิทย์ ตั้งอยู่ ณ วัดกระบี่ เลขที่ ๑๖๘ บ้านกระบี่เหนือ ตำบลหนองหญ้าลาด
อำเภอกันทรลักษ์ จังหวัดศรีสะเกษ
ปี พ.ศ. 2527 – 2543 พระครูบริหารกันทรลักษ์ (ศุภชัย ฐิตธมฺโม ) อดีตเจ้าอาวาสวัดกระบี่ และเจ้าคณะอำเภอกันทรลักษ์ ได้เปิดสำนักศาสนศึกษาเปิดสอนหลักสูตรพระปริยัติธรรม แผนกธรรม และแผนกบาลี ของแม่กองบาลี และธรรมสนามหลวง
ปี พ.ศ. 2537 พระครูบริหารกันทรลักษ์ได้ขอเปิดดำเนินการเรียนการสอนตามหลักสูตรพระปริยัติธรรม แผนกสามัญศึกษา จากกรมการศาสนา กระทรวงศึกษาธิการ (ในขณะนั้น) ปัจจุบันเป็นกองพุทธศาสนศึกษา สำนักงานพระพุทธศาสนาแห่งชาติ มหาเถรสมาคม
ในระยะแรกได้ดำเนินการสอนอยู่ที่วัดศิริวราวาส ตำบลน้ำอ้อม อำเภอกันทรลักษ์ จังหวัดศรีสะเกษ
คือตั้งแต่ปี พ.ศ. 2537 – 2541 โดยใช้ชื่อโรงเรียนว่า “ โรงเรียนพระปริยัติธรรมวัดศิริวราวาสวิทยา”
ในปี พ.ศ.2537 – 2539 ได้เปิดสอนมัธยมศึกษาตอนต้น
ในปี พ.ศ.2539 ได้ขออนุญาตเปิดสอนถึงมัธยมศึกษาตอนปลาย
ในปี พ.ศ.2541 ได้ย้ายจากวัดศิริวราวาส มาดำเนินการเรียนการสอนที่วัดกระบี่ ตำบลหนองหญ้าลาด
อำเภอกันทรลักษ์ จังหวัดศรีสะเกษ
ปี 2557 สมเด็จพระกนิษฐาธิราชเจ้า กรมสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดา ฯ สยามบรมราชกุมารี ทรงพระกรุณาโปรดเกล้า ฯ รับโรงเรียนพระปริยัติธรรม แผนกสามัญศึกษา จังหวัดศรีสะเกษ จำนวน 9 โรง คือ 1) โรงเรียนศรีเกษตรวิทยา 2) โรงเรียนพระปริยัติธรรมสามัญวัดบ้านโนนคูณวิทยา 3) โรงเรียนกันทรลักษ์ธรรมวิทย์ 4) โรงเรียนวัดสระกำแพงใหญ่ 5) โรงเรียนพระปริยัติธรรมเกียรติแก้ววิทยา 6) โรงเรียนดวนใหญ่วิทยา 7) โรงเรียนโพธิ์ศรีวิทยา 8) โรงเรียนวัดประชานิมิตโสภิตธรรมภาณ และ 9) โรงเรียนปรางค์กู่วิทยา ไว้ในโครงการพัฒนาเด็กและเยาวชนในถิ่นทุรกันดาร ตามพระราชดำริฯ
วันที่ ๑๕ มกราคม ๒๕๖๒ มูลนิธิ ฮารนามซิงห์ ฮารบันส์กอร์ (สัจจเทพ) ได้มาสำรวจพื้นที่โรงเรียนกันทรลักษ์ธรรมวิทย์ ตามที่โรงเรียนได้ทำหนังสือขอรับการสนับสนุนต่อเติมอาคารเรียนไป เนื่องจากอาคารที่ก่อสร้างค้างไว้ ยังไม่แล้วเสร็จ ไม่สามารถใช้ประโยชน์ในการจัดการเรียนการสอนได้ เมื่อมูลนิธิพิจารณาแล้ว จึงบริจาคเงินเพื่อต่อเติมอาคารเรียนให้แก่โรงเรียนกันทรลักษ์ธรรมวิทย์ จำนวน ๒,๗๓๖,๒๐๐ บาท ต่อมา มูลนิธิฯ ดำเนินการต่อเติมอาคารเรียนแล้วเสร็จสมบูรณ์ ได้น้อมเกล้าฯ ถวายอาคารเรียนที่ต่อเติมแล้วเสร็จ แด่สมเด็จพระกนิษฐาธิราชเจ้า กรมสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดา ฯ สยามบรมราชกุมารี
วันที่ ๕ มีนาคม ๒๕๖๒ สมเด็จพระกนิษฐาธิราชเจ้า กรมสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดา ฯ สยามบรมราชกุมารี เสด็จพระราชดำเนินไปทรงปฏิบัติพระราชกรณียกิจในพื้นที่จังหวัดศรีสะเกษ ณ โรงเรียนกันทรลักษ์ธรรมวิทย์ เพื่อติดตามผลการดำเนินงานตามแผนพัฒนาเด็กและเยาวชนในถิ่นทุรกันดาร
วันที่ ๓ พฤษภาคม ๒๕๖๔ สมเด็จพระกนิษฐาธิราชเจ้า กรมสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารีทรงติดตามการดำเนินงานโครงการพัฒนาคุณภาพชีวิตสามเณรแบบออนไลน์และทรงเปิดอาคารเรียน กูรมัคซิงห์ สัจจเทพ ณ โรงเรียนกันทรลักษ์ธรรมวิทย์ และพระราชทานให้มูลนิธิมูลนิธิ ฮารนามซิงห์ ฮารบันส์กอร์ (สัจจเทพ) สร้างโรงครัว จำนวนเงิน 1,400,000 บาท