Khoa Y được thành lập từ năm 2007 trực thuộc Trường Cao đẳng Y tế Cần Thơ, ngày càng phát triển, vững mạnh cả trong lĩnh vực đào tạo, nghiên cứu khoa học và phục vụ đào tạo. Hiện nay, hòa trong xu thế phát triển chung của khu vực và toàn cầu hoá đã và đang diễn ra nhanh chóng, rộng khắp trong mọi lĩnh vực: Kinh tế, chính trị, văn hoá, giáo dục, y tế... đòi hỏi chúng ta phải tăng tốc, đón đầu để phát triển một cách bền vững, không ngừng trao dồi kiến thức, học tập nâng cao trình độ để đáp ứng với nhu cầu phát triển của đất nước.

Là một cơ sở đào tạo nhân lực y tế có lịch sử lâu đời ở vùng Tây Nam bộ, Khoa Y có sứ mệnh  đào tạo nguồn nhân lực y tế nhằm phục vụ sự nghiệp chăm sóc sức khỏe nhân dân, phát triển các ngành khoa học sức khoẻ góp phần nâng cao nền y học nước nhà.

Khoa Y bao gồm năm bộ môn: Bộ môn Y học cơ sở, Bộ môn Sản, Bộ môn Nha, Bộ môn Phục hồi chức năng, Bộ môn Y tế công cộng; và một Trạm Y tế. Với lực lượng các Bác sĩ, cử nhân trẻ đầy tâm huyết, hăng hái xung phong trong công việc tham gia các hoạt động giảng dạy của nhà trường, tham gia khám, điều trị bệnh cho người bệnh tại bệnh viện, giảng dạy, quản lý học sinh sinh viên. Đồng thời tích cực tham gia các phong trào văn hóa văn nghệ, thể dục thể thao, khám bệnh từ thiện... trong và ngoài trường.

Từ khi thành lập tới nay Khoa Y đã đạt được: “Tập thể lao động xuất sắc” nhiều năm tại cơ sở, và  Bằng khen của UBND Thành phố Cần Thơ.