Sebagai pendidikan berbasis pesantren, peran bagian kesantrian sangat penting bagi keberhasilan pendidikan di Pondok Nurus Sunnah. Kesantrian merupakan salah satu dari dua pilar pendidikan selain sekolah dalam lingkungan pendidikan pesantren. Dalam praktiknya kesantrian bertugas sebagai pendisiplinan kegiatan dan pembina penerapan ilmu dalam kehidupan sehari-hari bagi santri ponpes.

MUDIR : Ustadz Achmad Nurudin AS B.A

Wakil Mudir Putri: Ustadzah Indah Riska Rastikah B.A

Kepala Kesantrian Putra: Ustadz Achmad Ihza Nur Rofiq B.A