Tugas Kepala Kantor Kementerian Agama (Kemenag) Kabupaten/Kota adalah melaksanakan tugas dan fungsi Kemenag di wilayahnya. Kepala Kemenag Kabupaten/Kota bertanggung jawab kepada Kepala Kantor Wilayah Kemenag provinsi. 

Tugas Kemenag Kabupaten/Kota meliputi: 

1. Merumuskan dan menetapkan visi, misi, dan kebijakan teknis di bidang pelayanan dan bimbingan kehidupan beragama

2. Melakukan pelayanan, bimbingan, dan pembinaan di bidang pendidikan agama, keagamaan, dan madrasah

3. Membina kerukunan umat beragama

4. Melakukan pengelolaan data dan informasi

5. Menyusun rencana dan pelaporan

6. Mengkoordinasikan perencanaan, pengendalian, pengawasan, dan evaluasi program

7. Melakukan hubungan dengan pemerintah daerah, instansi terkait, dan lembaga masyarakat