劉哲文教授目前任職於慈濟大學醫學系生化學科，從事生物資訊學、結構生物學和微生物學方面的研究。他目前的主要研究為“丙型肝炎病毒結構蛋白與宿主之間的交互作用”、“抗菌肽的設計和蛋白質/胜肽工程”以及“細胞表面受體的生物資訊學分析與生物物理/生物化學/細胞學/動物實驗研究”。