帶鳥寶做健康檢查是很重要的一件事，醫生透過抹片檢查在顯微鏡下觀察糞便，除了檢查其中是否有寄生蟲外也可以看到體內病菌狀況，在以下介紹幾個在綠繡眼糞便中曾檢查出的病菌給大家參考。
※以下防治及處理建議僅供參考，若有出現異狀請盡快找獸醫師，且勿自行投藥。※內容參考：國立中興大學動物科學系畜產經營研究室
念珠菌感染Thrush
念珠菌對於許多鳥類而言，是屬於常在菌，鳥體本身就會帶有。
這個常在菌會因生活衛生較差或是感到壓力緊迫，營養不良或不均衡、抵抗力差、長期服用抗生素、環境潮濕（飼料沒有經常更換導致受潮有黴菌也是原因之一）等原因，讓念珠菌有機可乘，容易會發作。
如果家中其他的鳥寶剛好也有免疫力低下的狀況，就會有傳染可能。
臨床症狀
食慾減退、體重減輕、嗜睡、嘔吐、拒絕進食、咳血、口腔出現白斑、噴口水且口水或口腔周圍出現白色或是黃色黏液，呈乾酪樣偽膜（若嚴重時口腔黏液會轉換成黃灰白色隆起潰瘍）、嗉囊食道變厚、食滯、鳥喙附近的羽毛經常沾了甩出的食物、帶有甜味的下痢便。有時前胃，共泄腔，呼吸道及皮膚也有病變。
防治與日常環境建議：
平常營養給的很均衡的鳥，生病時體力不會下降很快，所以飼主平常一定要多注意觀察，有跟平常不一樣的行為還有症狀就要注意了。
日常飲食飲水需每日更換、食器籠具每天清洗、鳥寶居住環境的衛生也很重要，平時溫度要維持27～29度、濕度不要太高，保持通風，以便防止此病。
照片為綠繡眼／小不點 20200816糞便檢驗影像
巨大細菌感染 Megabacterial
一般並不認為空氣會傳染此病。而以食入受到病鳥糞便污染的飲水和食物而感染。
Megabacteria由字面上來看，病原似乎是一種巨大的細菌，染色後在顯微鏡底下觀看，它呈現格蘭氏陽性大型杆狀，但較新的理論卻可能將它規類為酵母菌。可在鳥的前胃，肌胃及腸道發現此菌。偶爾也可在嗉囊發現。
吐料動作也可能傳染此病。 許多鳥都會感染此病，但愛情鳥、金絲雀、雀科及虎皮鸚鵡等小型鳥的發生率更高。
臨床症狀
由於患鳥消化吸收不良，有時雖食欲增加，但體重卻減輕。羽毛鬆散、下痢、排出如柏油狀的黑色或红黑色黏液便，糞便呈泡沫狀，排出未消化的種子。嘔吐、腹部腫大。 患鳥可能會死於寄生蟲或细菌等二次感染。
但不一定所有得病的鳥都會出現臨床症狀。
防治與處理方法
有人建議可在食物添加乳酸菌，可使胃內酸鹼度下降，較不利於該菌繁殖。