De organisatie stimuleert kennisbenutting en bevordert de overdracht van kennis naar de maatschappij.
NWO wordt bestuurd door de raad van bestuur en bestaat uit verschillende organisatieonderdelen:
domeinen, (onderzoeks)instituten en tijdelijke regieorganen.
Deze hebben elk hun eigen werkveld en bestuur.
NWO is medeorganisator van de Nationale Wetenschapsquiz.
De domeinen van NWO verstrekken financiering, veelal binnen onderzoeksprogramma's, speciaal voor onderzoekers uit hun specifieke disciplines. De domeinen hebben daartoe eigen budgetten, een eigen bestuur en directie.
Medische Wetenschappen is in 2001 ondergebracht bij ZonMw. / ZonMW.nl zoek rapport / onderzoeksrapport
WOTRO Science for Golbal Development is en domeindoorsnijdend initiatief.
NWO heeft negen onderzoeksinstituten die een strategische bijdrage aan het Nederlandse universitaire onderzoek leveren. Ze coördineren en faciliteren onderzoek op nationale schaal en zijn de thuisbasis voor grote, vaak internationale, onderzoeksvoorzieningen:
De instituten worden ondergebracht in de NWO-institutenorganisatie (NWO-I). nwo-i.nl / zoek rapport / report
NLeSc (Netherlands eScience Center, in samenwerking met SURF) surf.nl maakt deel uit van NWO. / zoek rapport / report
Data Archiving and Networked Services (DANS) is een instituut van KNAW en NWO. / zoek rapport / report
Stichting voor Fundamenteel Onderzoek der Materie (FOM) en Technologiestichting STW zijn per 1 januari 2017 opgegaan in NWO.
De NWO-regieorganen zijn tijdelijke onderdelen met speciale aandacht voor één, vaak multidisciplinair, onderzoeksveld.