Este centro educativo fue creado el año de 1999 mediante decreto legislativo no.139-99 a iniciativa del patronato de la colonia y con el apoyo del diputado Marco Antonio Andino. en el paso del huracán Mich se le dio el nombre de Instituto Japón con el propósito que el gobierno de Japón nos ayudara en el desarrollo del Instituto. En sus inicios en el año 2000, el Instituto funciono en la escuela " Emma Romero de Callejas", con una matricula de 120 estudiantes, atendidos por 12 maestros en el área de ciclo común de la jornada nocturna. A partir del año 2002 se creo la carrera de Educación Comercial y en el año de 2007 se inicio atender la modalidad de bachillerato en ciencias y letras y Técnico en computación.
En el año 2013 se inicio con la conversación de bachillerato en Ciencias en y Letras y Técnico en computación al Bachillerato Técnico Profesional en Informática. Y en el año 2014 se inicia con la conversación de educación Comercial al Bachillerato Técnico profesional en Contaduría y Finanzas.
Desde el inicio se gestiono la obtención del terreno para construir el edificio del centro educativo. Para ello se ha organizado un comité pro-construcción que ha desarrollado actividades de autogestión, con aportaciones económicas de profesores, padres de familia, miembros de la comunidad y amigos del instituto que ha distribuido en el desarrollo de nuestro centro educativo.
La dirección del instituto con el apoyo del personal docente, padres de familia y patronado de la comunidad esta pagando el terreno de 5,000 v ubicado a la orilla del anillo periférico propiedad de la familia Sequeiros.
Este compromiso es transitorio, porque se espera obtener el pago del terreno a través de gestiones realizados en la secretaria de Educación y el Congreso Nacional.
A finales del año 2008 e inicios de 2009, se logro la construcción de 3 aulas de clases en el terreno donde funcionara el instituto con ayudas del congreso Nacional del Republica y actividades económicas que ha realizado el personal, alumnado y Sociedad de padres de familia.
En el año 2010 se inicio a funcionar en el local propio del instituto contando con 3 aulas de clases. En el año 2012 se termino de construcción de 3 aulas de clases con ayuda de la fundación " Done una aula " " Canal 10", " la Tribuna " y la " Tabacalera hondureña " padres de familia, docentes y estudiantes. Las gestiones a deferencia dependencias gubernamentales continúan ya que son muchos las necesidades del Centro Educativo.