Introdução: A pandemia de COVID-19 impôs mudanças aos trabalhadores, podendo impactar na sua saúde e capacidade para o trabalho. As condições de percepção do trabalhador, em relação à sua saúde, podem influenciar o desempenho profissional. Assim, nossa hipótese é que haverá associação entre a percepção de saúde do trabalhador e a capacidade para o trabalho. Objetivos: O objetivo do estudo é testar a associação entre a percepção geral de saúde e a capacidade para o trabalho dos trabalhadores brasileiros durante os primeiros 12 meses da pandemia do COVID-19. Metodologia: Trata-se de um estudo longitudinal da coorte IMPPAC (CAAE: 31885020.9.0000.5504). Os participantes responderam aos formulários eletrônicos de junho a setembro de 2020 e nos mesmos meses no ano de 2021. Foram usados os instrumentos, Índice de Capacidade para o Trabalho (ICT) e COPSOQ II-Br. A amostra foi composta por 1211 trabalhadores de diversos setores. Os dados foram analisados de forma descritiva e com regressão linear no software SPSS. Com nível de significância de 5%. Resultados: A idade média foi 38 anos (DP:10,5); 52% eram mulheres, 40% usam alguma medicação, 6% fumantes, 36% brancos e 11% pardos, 55% casados e 39% solteiros, 37% eram do setor da educação e 18% da saúde. Sobre a percepção de saúde (PS), 41% disseram ser muito boa, 36% boa, 12% excelente, 9% razoável e 2% ruim. O ICT reportado após 12 meses era bom (47%), excelente (28%), moderado (22%) e baixo (3%). Houve associação entre a PS e o ICT após 12 meses (B: 2,97; IC95%: 2,52-3,41; p<0,01). Conclusão: Nosso estudo destacou a relevância da percepção de saúde do trabalhador. Estratégias de prevenção e promoção de saúde que provoquem melhora na percepção da saúde do trabalhador são importantes para melhorar sua capacidade para o trabalho e desempenho profissional.