หน้าที่ศูนย์นวัตกรรมสมุนไพรทางเลือก มีภาระหน้าที่รับผิดชอบเกี่ยวกับการสร้างเครือข่ายและความร่วมมือด้านการวิจัยและการผลิตสมุนไพร พืชสมุนไพร ภูมิปัญญาการใช้สมุนไพร สำหรับการดูแลสุขภาพร่วมกับภูมิปัญญาท้องถิ่น เพื่อเป็นการลดค่าใช้จ่ายในการรักษาโรค และเกิดภูมิปัญญาร่วมกับการผลิตคิดค้น ผลิตภัณฑ์สมุนไพรพัฒนาคุณภาพชีวิตด้านสุขภาพอย่างต่อเนื่องและยั่งยืน รวมถึงผลิตผลิตภัณฑ์เครื่องสำอาง อาหารเสริม เครื่องดื่มสมุนไพรและยาภายใต้การผลิตที่ครบวงจรเพื่อเป็นการการสร้างรายได้ให้กับมหาวิทยาลัย พัฒนางานนวัตกรรมค้านสมุนไพรทางเลือก เพื่อสร้างความเป็นเลิศทางวิชาการ และการใช้ประโยชน์เชิงนโยบาย เชิงเศรษฐกิจและสังคม คิดค้น พัฒนาสูตรตำรับ ผลิตภัณฑ์สมุนไพร เพื่อส่งเสริมการใช้สมุนไพรทางเลือกและต่อยอดสู่เชิงพาณิชย์ให้การสนับสนุนการ จัดการเรียนการสอนและการฝึกปฏิบัติงานของนักศึกษา ศูนย์การเรียนรู้ ฝึกอบรม และให้บริการวิซาการแก่สังคมด้านสมุนไพร เพื่อสนับสนุนการใช้ สมุนไพรครบวงจร เชื่อมโยงระบบฐานข้อมูลพืชสมุนไพร ภูมิปัญญาการใช้สมุนไพรองค์ความรู้ภูมิปัญญาการใช้ สมุนไพรทางเลือก ส่งเสริม อนุรักษ์ ฟื้นฟู และคุ้มครองภูมิปัญญาสมุนไพรทางเลือกและจัดทำคู่มือการปฏิบัติงาน รวมถึงกำหนดนโยบายในการบริหารงานและการดำเนินงานที่เกี่ยวข้องในหน้าที่ที่รับผิดชอบให้ครอบคลุมเพื่อให้หน่วยงานภายในมหาวิทยาลัยมีมาตรฐานและแนวทางในการยึดถือปฏิบัติเป็นไปในทิศทางเดียวกัน และปฏิบัติงานอื่นๆ ตามที่ได้รับมอบหมาย