Rákoskeresztúron és Rákoshegyen az 1900-as években kezdődött meg a baptista misszió. A hívek ekkor családi házaknál jöttek össze. Az Igét a közeli gyülekezetekből átjáró lelkipásztorok hirdették.

1905-ben kb. húsz taggal, Bán Gábor lelkipásztor vezetésével megalakult a Rákoshegyi Baptista Gyülekezet. A gyülekezet egyik tagja, Lehotzky József szívében azt a döntést munkálta ki Isten, hogy házát a gyülekezetnek adományozza. Ez lett a gyülekezet első saját összejöveteli helye. 

Mivel a hívek száma gyarapodott, a gyülekezet imaház építésbe fogott. 1925 októberében így került sor az első rákoshegyi baptista imaház felavatására a Kölcsey utcában. Az addigi összejöveteli helyből pedig lelkipásztori lakás lett.

1935-re a gyülekezet 45 tagúra nőtt, és irányítását Baranyay Mihály, majd Kalkó József vették át. Őket 1946-ban Cseri Kálmán követte, később Szebeni Olivér, és Marsal János következtek. Ezalatt az imaházat kétszer is megnagyobbították, azonban az 1980-as évek végére már ez is kicsinek bizonyult. Kiss Emil idejében a 76 tagú gyülekezet ünnepi alkalmain gyakran 120-150 fő is jelen volt, az idősebb hívek ilyenkor hangot adtak régi álmuknak: „Milyen jó volna, ha a régi zsinagóga egyszer a mi imaházunk lehetne”. 

Ekkoriban került a gyülekezetbe Gubán György üzletember, aki frissen megtérve Isten iránti hálából 1989-ben megvásárolta a volt zsinagógát a Magyar Tudományos Akadémiától. Az ingatlan 1993-ban került a Magyarországi Baptista Egyház nevére. A felújítás sok áldozatkész társadalmi munka és adomány segítségével valósulhatott meg. 

1997 nyarán Szegedi Tivadar lelkipásztor vezetésével kezdődtek meg az istentiszteletek a volt zsinagógában. Az ő munkássága során sok új család tért meg és csatlakozott a gyülekezethez. Bábcsoportunk mind a kerületünkben, mind országszerte ismert volt. Ekkor alakult a dunavarsányi leánygyülekezetünk, és kezdődött Vaján a cigány gyülekezet plántálása is. Közösségünkből indult útjára Láng Emese, aki férjével, Riaannal jelenleg is bibliafordítói munkát végez Afrikában.

Nemeshegyi Dávid lelkipásztor ideje alatt folytatódott a részvételünk a kerület családi eseményein: majálison, Helikopter-napokon és az autómentes napon. 2013 végétől 2017 elejéig Örömkút néven népszerű ifjúsági istentiszteleteket tartottunk. A fiatalok most péntekenként találkoznak az ifi alkalmakon. 

2023-tól Csernus Máté gyülekezetünk lelkipásztora.

A következő években is szeretnénk Istenünk jelenlétét közvetíteni kerületünk és ismerőseink felé.