Single-molecule imaging of microRNA-mediated gene silencing in cells.
Hotaka Kobayashi, Robert H Singer.
Nature Communications. 13(1):1435. 2022
https://doi.org/10.1038/s41467-022-29046-5
Identification of an AGO (Argonaute) protein as a prey of TER94/VCP.
Hotaka Kobayashi, Yukihide Tomari.
Autophagy. 16(1):190-192. 2020
https://doi.org/10.1080/15548627.2019.1691351
VCP machinery mediates autophagic degradation of empty Argonaute.
Hotaka Kobayashi, Keisuke Shoji, Kaori Kiyokawa, Lumi Negishi, Yukihide Tomari.
Cell Reports. 28(5):1144-1153. 2019
https://doi.org/10.1016/j.celrep.2019.07.003
Iruka eliminates dysfunctional Argonaute by selective ubiquitination of its empty state.
Hotaka Kobayashi, Keisuke Shoji, Kaori Kiyokawa, Lumi Negishi, Yukihide Tomari.
Molecular Cell. 73(1):119-129. 2019
https://doi.org/10.1016/j.molcel.2018.10.033
RISC assembly: Coordination between small RNAs and Argonaute proteins.
Hotaka Kobayashi, Yukihide Tomari.
Biochimica et Biophysica Acta. 1859(1):71-81. 2016
https://doi.org/10.1016/j.bbagrm.2015.08.007
Measurement of Rab35 activity with the GTP-Rab35 trapper RBD35.
Hotaka Kobayashi, Kan Etoh, Soujiro Marubashi, Norihiko Ohbayashi, Mitsunori Fukuda.
Methods in Molecular Biology. 1298:207-216. 2015
https://doi.org/10.1007/978-1-4939-2569-8_18
Rab35 promotes the recruitment of Rab8, Rab13, and Rab36 to recycling endosomes through MICAL-L1 during neurite outgrowth.
Hotaka Kobayashi, Kan Etoh, Norihiko Ohbayashi, Mitsunori Fukuda.
Biology Open. 3(9):803-814. 2014
https://doi.org/10.1242/bio.20148771
Rab35 is translocated from Arf6-positive perinuclear recycling endosomes to neurite tips during neurite outgrowth.
Hotaka Kobayashi, Kan Etoh, Mitsunori Fukuda.
Small GTPases. 5:e29290. 2014
https://doi.org/10.4161/sgtp.29290
Arf6, Rab11, and transferrin receptor define distinct populations of recycling endosomes.
Hotaka Kobayashi, Mitsunori Fukuda.
Communicative & Integrative Biology. 5:e25036. 2013
https://doi.org/10.4161/cib.25036
Rab35 establishes the EHD1-association site by coordinating two distinct effectors during neurite outgrowth.
Hotaka Kobayashi, Mitsunori Fukuda.
Journal of Cell Science. 126(11):2424-2435. 2013
https://doi.org/10.1242/jcs.117846
Rab35 regulates Arf6 activity through centaurin-β2 (ACAP2) during neurite outgrowth.
Hotaka Kobayashi, Mitsunori Fukuda.
Journal of Cell Science. 125(9):2235-2243. 2012
microRNAによる遺伝子サイレンシングの1分子解析
元起 寧那, 泊 幸秀, 小林 穂高.
生物物理(日本生物物理学会) 63(3):160-162. 2023
https://doi.org/10.2142/biophys.63.160
miRNA
小林 穂高, 松浦 絵里子, 泊 幸秀.
ノンコーディングRNA(化学同人社)6章. 2016
http://www.kagakudojin.co.jp/book/b227362.html
エンドソーム
小林 穂高, 福田 光則.
脳科学辞典(日本神経科学学会) 2013
https://doi.org/10.14931/bsd.1039
Rabファミリー低分子量Gタンパク質
小林 穂高, 福田 光則.
脳科学辞典(日本神経科学学会) 2012
RNAサイレンシングの実行因子であるアルゴノートタンパク質の分解機構を解明 特定の遺伝性疾患の病態理解にも可能性
日本の研究.comニュース. 2019年 8月
https://research-er.jp/articles/view/81291
RNAサイレンシングの実行因子であるアルゴノートタンパク質の分解機構を解明
東京大学PRESS RELEASES. 2019年7月
https://www.u-tokyo.ac.jp/focus/ja/press/z0207_00016.html
The empty octopus in the cell: Researchers identify how the protein Argonaute is targeted for recycling to maintain microRNA function.
UTokyo FOCUS. July 2019
https://www.u-tokyo.ac.jp/focus/en/articles/z0508_00048.html
10,000 leagues under the cell: Researchers give nautical name to newly characterized protein important for gene regulation by microRNAs.
UTokyo FOCUS. November 2018
https://www.u-tokyo.ac.jp/focus/en/press/z0508_00019.html
遺伝子の発現調節を担うアルゴノートタンパク質の品質管理機構を解明
東京大学PRESS RELEASES. 2018年11月
https://www.u-tokyo.ac.jp/focus/ja/press/z0207_00009.html
遺伝子の発現調節を担うアルゴノートタンパク質の品質管理機構を解明 細胞内の「イルカ」が悪いアルゴノートを食べる
日本の研究.comニュース. 2018年11月
https://research-er.jp/articles/view/75695
東大、遺伝子の発現調節を担うアルゴノートタンパク質の品質管理機構を解明
日本経済新聞. 2018年11月
高時空間解像度イメージングという視点から翻訳の典型的・非典型的な制御機構に迫る
日本学術振興会 科学研究費助成事業 学術変革領域研究(A)
2023 - 2025
RISCの機能発現を1分子mRNAレベルで「見る・操る」
科学技術振興機構 戦略的創造研究推進事業 さきがけ
2021 - 2024
オートファジーを介したmicroRNA非結合型Argonauteの分解機構の解明
日本学術振興会 科学研究費助成事業 研究活動スタート支援
2017 - 2019
IrukaによるmicroRNA非結合型Argonauteの選択的ユビキチン化機構の解析
内藤記念科学振興財団 内藤記念特定研究助成
2017 - 2018
国立大学改革強化推進補助金スタートアップ支援経費
文部科学省 国立大学改革強化推進補助金
2017 - 2018
網羅的オルガネラ解析ツールRabを用いた新規RNAサイレンシング制御機構の解明
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費(SPD)
2014 - 2017
Rab35-centaurinβ2複合体による神経突起伸長メカニズムの解明
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費(DC1)
2011 - 2014
メンブレントラフィックを切り口とした神経突起伸長制御メカニズムの解明
東北大学 国際高等研究教育機構 研究教育院生研究費
2010 - 2014