หลักสูตรวิศวกรรมศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาวิศวกรรมโยธา มีรายวิชาและเนื้อหาที่หลากหลายและครอบคลุมงานด้านวิศวกรรมโยธา ใน 5 กลุ่มวิชา ประกอบด้วย วิศวกรรมขนส่ง วิศวกรรมโครงสร้าง วิศวกรรมธรณีเทคนิค วิศวกรรมชายฝั่งและมหาสมุทร และวิศวกรรมก่อสร้างและการจัดการ ซึ่งตอบโจทย์ความต้องการในการพัฒนางานวิศวกรรมโยธาและโครงสร้างพื้นฐานของท้องถิ่น ภาคใต้ และประเทศ
หลักสูตรเปิดรับ 2 แผนการเรียน คือ แผน ก1 (Thesis only) และ แผน ก2 (Course work) รวมทั้งมีโครงการ ตรี-โท 5 ปี ทั้งนี้ ผู้เรียนสามารถเลือกเรียนรายวิชาที่หลากหลายข้ามกลุ่มวิชาได้ นอกจากนี้ ผู้เรียนสามารถเลือกทำวิทยานิพนธ์จากคณาจารย์ที่มีความเชี่ยวชาญและประสบการณ์ในการทำงานวิจัยและงานบริการวิชาการ เพื่อให้คำแนะนำต่อการทำวิทยานิพนธ์ ที่จะเป็นส่วนหนึ่งของการพัฒนางานวิศวกรรมโยธาและโครงสร้างพื้นฐานของประเทศ ในยุคที่โลกเปลี่ยนแปลง
หลักสูตรปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาวิชาวิศวกรรมโยธา มีรายวิชาและเนื้อหาที่หลากหลายและครอบคลุมงานด้านวิศวกรรมโยธา ใน 5 กลุ่มวิชา ประกอบด้วย วิศวกรรมขนส่ง วิศวกรรมโครงสร้าง วิศวกรรมธรณีเทคนิค วิศวกรรมชายฝั่งและมหาสมุทร และวิศวกรรมก่อสร้างและการจัดการ ซึ่งตอบโจทย์ความต้องการในหลากหลายมิติของการพัฒนางานด้านวิศวกรรมโยธาและโครงสร้างพื้นฐานของประเทศและนานาชาติ ทั้งในเชิงลึกและภาพกว้าง
หลักสูตรเปิดรับ 1 แผนการเรียน คือ แผน 1.1 (Thesis only) ซึ่งเหมาะกับผู้ที่ต้องการเพิ่มศักยภาพในการทำวิจัยปัญหาและงานวิศวกรรมโยธาในเชิงลึก โดยสามารถเลือกอาจารย์ที่ปรึกษาวิทยานิพนธ์ ซึ่งมีความเชี่ยวชาญและมีประสบการณ์ด้านการสอน การทำวิจัย และการทำงานบริการวิชาการ เพื่อให้คำปรึกษาในการทำวิทยานิพนธ์ อันจะช่วยในการพัฒนางานด้านวิศวกรรมโยธาและโครงสร้างพื้นฐานของประเทศและนานาชาติ ในยุคที่โลกเปลี่ยนแปลงอย่างรวดเร็ว