※話数順

・煉獄関篇　6巻42～44訓
　アニメ 27話（1年目）

・銀時記憶喪失篇　7巻50～52訓
　アニメ 31～32話（1年目）

・星海坊主篇　7巻57訓～8巻63訓
　アニメ 40～42話（1年目）

・隠し子篇（勘七郎篇）　10巻77～80訓
　アニメ 51～52話（2年目）

・紅桜篇　11巻89訓～12巻97訓
　アニメ 58～61話（2年目）

・柳生編　13巻110訓～15巻123訓
　アニメ 76～81話（2年目）

・ミツバ篇　15巻129訓～16巻132訓
　アニメ 86～87話（2年目）

・芙蓉篇　17巻140～146訓
　アニメ 69～71話（2年目）

・真選組動乱篇　19巻158訓～20巻168訓
　アニメ 101～105話（3年目）

・竜宮篇　20巻174訓～21巻182訓
　アニメ 115～118話（3年目）

・魔死呂威組篇（中村京次郎篇）　21巻184訓～22巻186訓
　アニメ 107～108話（3年目）

・モンハン篇（ドライバー篇）　22巻189～192訓
　アニメ 121～123話（3年目）

・幽霊旅館篇（スタンド温泉篇）　23巻196～201訓
　アニメ 131～134話（3年目）

・文通篇　24巻203～206訓
　アニメ 126～128話（3年目）

・吉原炎上篇　25巻210訓～26巻228訓
　アニメ 139～146話（3年目）

・寺門通ファンクラブ篇（OFC篇）　28巻239～245訓
　アニメ 157～163話（4年目）

・たまクエ篇（白血球王篇）　29巻247～251訓
　アニメ 167～170話（4年目）

・紅蜘蛛篇（地雷亜篇）　29巻254訓～30巻262訓
　アニメ 177～181話（4年目）

・人気投票篇　31巻265～268訓
　アニメ 182～184話（4年目）

・六角屋篇　31巻270～272訓
　アニメ 186～187話（4年目）

・かぶき町野良猫篇（猫化篇）　32巻275～279訓
　アニメ 190～192話（4年目）

・陰陽師篇（お天気戦争篇）　32巻282訓～33巻289訓
　アニメ 195～199話（4年目）

・かぶき町四天王篇　34巻297訓～35巻309訓
　アニメ 210～214話（銀魂’）

・六股篇　39巻336～339訓
　アニメ 239～240話（銀魂’）

・ラブチョリス篇　40巻347～350訓
　アニメ 228～229話（銀魂’）

・蓮蓬編　41巻353～360訓
　アニメ 232～236話（銀魂’）

・バラガキ篇　42巻365～370訓
　アニメ 244～247話（銀魂’）

・金魂篇　43巻372～380訓
　アニメ 253～256話（銀魂’ 延長戦）

・一国傾城篇　44巻386訓～45巻399訓
　アニメ 257～261話（銀魂’ 延長戦）

・恒道館道場篇（尾美一篇）　46巻402～409訓
　アニメ 262～264話（銀魂’ 延長戦）

・魔剣マガナギ篇　48巻424訓～49巻429訓
　アニメ 334～336話（銀魂．）

・性別逆転篇（デコボッコ篇）　50巻437～441訓
　アニメ 275～277話（銀魂゜）

・アイドル篇　50巻445訓～51巻449訓
　アニメ 337～339話（銀魂．）

・死神篇（処刑人篇）　52巻463訓～53巻469訓
　アニメ 279～281話（銀魂゜）

・魂入れ替わり篇　53巻470～476訓
　アニメ 287～289話（銀魂゜）

・快援隊過去編　54巻477～480訓
　アニメ 290～291話（銀魂゜）

・斉藤終篇　55巻488～491訓
　アニメ 294～295話（銀魂゜）

・愛染香篇　55巻492～496訓
　アニメ 295.5話（単行本65,66巻特別同梱DVD）

・将軍暗殺篇　56巻502訓～58巻524訓
　アニメ 300～307話（銀魂゜）

・さらば真選組篇　59巻525訓～61巻551訓
　アニメ 308～316話（銀魂゜）

・烙陽決戦篇　62巻552訓～66巻595訓
　アニメ 317～328話（銀魂．）

・銀ノ魂篇　66巻596訓～74巻668訓
　アニメ 342話～361話（銀魂．）

・最終章二年後篇　74巻669訓～77巻704訓
　アニメ 362話～（銀魂．）