• 심혈관질환의 발병 및 진행에 대한 위험요인 발굴 및 인과성 규명을 위해 유전체 및 마이크로바이옴 데이터를 활용한 연구 (한국연구재단 중견과제)

• 한국인의 장 마이크로바이옴 구성에 영향을 끼치는 호스트 유전 변이 발굴 연구

• 알츠하이머질환에 대하여 다중유전자위험점수(Polygenic risk score, PRS)를 이용한 질환 예측모델 개발 연구

• 멘델리안무작위법(Mendelian Randomization, MR)을 이용한 알츠하이머질환에 대한 위험요인에 대한 인과성 규명

• 강북삼성코호트 기반 만성질환에 대한 장 마이크로바이옴 연관성 연구

- 소화기질환(위암, 위염, 대장염, 담석증, 지방간 등)

- 정신질환(우울, 불안, 수면, 성격 등)

- 감염질환(만성 B형 간염, 코로나 19 등)

- 피부질환(건선, 홍조 등)

- 기타(근육량, 비만, 지질, 전립선 등)

• 삼성서울병원 임상 각 과와의 협업연구

- 혈액종양내과: 폐암 환자의 면역치료 반응성과 장 마이크로바이옴의 연관성 연구

- 소아청소년과: 미숙아의 위흡인액 마이크로바이옴 연구

- 소화기내과: 간암환자의 면역치료 반응성과 마이크로바이옴의 연관성 연구

- 신경과: 알츠하이머 환자에 대한 장 마이크로바이옴 연구 (SMC CRP 과제)

• CS-IRTG (The Cologne-Seoul International Research Training Group): https://www.cs-irtg.com/

- 한국-독일 국제전략연구그룹

- 한국 성균관대학교 SAIHST - 독일 퀼른대학교 공동연구 및 인재 양성 사업

- 연구과제명: 폐암에서 종양 이질성과 유전체 불안정성의 탐색을 통한 종양 기본 메커니즘과 임상 적용을 위한 연구

- 연구기간: 2025.04.01-2034.03.31

• GLGC (Global Lipids Genetics Consortium): https://www.lipidgenetics.org/#

- 지질 형질에 대한 대규모 글로벌 유전체 컨소시엄

- 한국인 데이터로 참여

- 협업연구로 출판된 논문

• • • Stavroula Kanoni , Sarah E Graham , Yuxuan Wang , Ida Surakka, Shweta Ramdas, Xiang Zhu,.., Han-Na Kim, et al.  Implicating genes, pleiotropy, and sexual dimorphism at blood lipid loci through multi-ancestry meta-analysis. Genome Biology. 2022 Dec 27;23(1):268.  doi: 10.1186/s13059-022-02837-1. (member of the consortium)

    • Shweta Ramdas, Jonathan Judd, Sarah E Graham, Stavroula Kanoni, Yuxuan Wang, Ida Surakka, Brandon Wenz, …, Han-Na Kim, et al. A multi-layer functional genomic analysis to understand noncoding genetic variation in lipids. American Journal of Human Genetics. 2022 Aug 4;109(8):1366-1387. doi: 10.1016/j.ajhg.2022.06.012. (member of the consortium)

    • Sarah E Graham, Shoa L Clarke, Kuan-Han H Wu, Stavroula Kanoni, Greg J M Zajac, Shweta Ramdas, …, Han-Na Kim et al. The power of genetic diversity in genome-wide association studies of lipids. Nature. 2021 Dec 9; 600, pages 675–679. doi: 10.1038/s41586-021-04064-3. (member of the consortium)

• GIANT (Genetic Investigation of ANthropometric Traits): https://portals.broadinstitute.org/collaboration/giant/index.php/GIANT_consortium

- 신체 계측 형질에 대한 대규모 글로벌 유전체 컨소시엄

- 한국인 데이터로 참여

- 협업연구로 출판된 논문

• • • Niall J Lennon, Leah C Kottyan, Christopher Kachulis, Noura S Abul-Husn, Josh Arias, Gillian Belbin, Jennifer E Below, Sonja I Berndt, Wendy K Chung, James J Cimino, Ellen Wright Clayton, John J Connolly, David R Crosslin, Ozan Dikilitas, Digna R Velez Edwards, QiPing Feng, Marissa Fisher, Robert R Freimuth, Tian Ge, GIANT Consortium, et al. Selection, optimization and validation of ten chronic disease polygenic risk scores for clinical implementation in diverse US populations. Nature Medicine. 2024 Feb;30(2):480-487. doi: 10.1038/s41591-024-02796-z. (member of the consortium)

    • John M. Baronas, Eric Bartell, Anders Eliasen, John G. Doench, Loic Yengo, Sailaja Vedantam,Eirini Marouli, GIANT Consortium, Henry M. Kronenberg, Joel N. Hirschhorn, and  Nora E. Renthal∗. Genome-wide CRISPR screening of chondrocyte maturation newly implicates genes in skeletal growth and height-associated GWAS loci. Cell genomics. 2023 May 10; 3(5): 100299. (member of the consortium)

    • Loïc Yengo, Sailaja Vedantam, Eirini Marouli,…, Han-Na Kim, et al. A saturated map of common genetic variants associated with human height. Nature. 2022 Oct;610(7933):704-712.  doi: 10.1038/s41586-022-05275-y. (member of the consortium)

• COVID-19 HGI (Covid-19 Host Genetics Initative): https://www.covid19hg.org/

- 코로나바이러스에 대한 숙주 유전체 연구 글로벌 컨소시엄

- 한국인 데이터로 참여. 한국팀 리더

- 협업연구로 출판된 논문

• COVID-19 Host Genetics Initiative. Mapping the human genetic architecture of COVID-19. Nature. 2021 Dec;600(7889):472-477.  doi: 10.1038/s41586-021-03767-x. (member of the consortium)

• MiBioGen (Microbiome Genome wide association study)

- 장 마이크로바이옴에 대한 숙주 유전체 연구 글로벌 컨소시엄

- 한국인 데이터로 참여. 한국팀 리더

- 협업연구로 출판된 논문

• Alexander Kurilshikov, Carolina Medina-Gomez, Rodrigo Bacigalupe, Djawad Radjabzadeh, Jun Wang, Ayse Demirkan, Caroline I. Le Roy, Juan Antonio Raygoza Garay, Casey T. Finnicum, Xingrong Liu, Daria V. Zhernakova, Marc Jan Bonder, Tue H. Hansen, Fabian Frost, Malte C. Rühlemann, Williams Turpin, Jee-Young Moon, Han-Na Kim, et al. Large-scale association analyses identify host factors influencing human gut microbiome composition. Nature Genetics. 2021 Feb;53(2):156-165. doi: 10.1038/s41588-020-00763-1. (member of the consortium)

• Jun Wang*, Alexander Kurilshikov, Djawad Radjabzadeh, Williams Turpin, Kenneth Croitoru, Marc Jan Bonder, Matthew A. Jackson, Carolina Medina-Gomez, Fabian Frost, Georg Homuth, Malte Rühlemann, David Hughes, Han-na Kim, MiBioGen Consortium Initiative, Tim D. Spector, Jordana T. Bell, Claire J. Steves, Nicolas Timpson, Andre Franke, Cisca Wijmenga, Katie Meyer, Tim Kacprowski, Lude Franke, Andrew D. Paterson, Jeroen Raes*, Robert Kraaij*, and Alexandra Zhernakova*; Meta-analysis of human genome-microbiome association studies: The MiBioGen consortium initiative. Microbiome. 2018 Jun 8;6(1):101. doi: 10.1186/s40168-018-0479-3.