ศูนย์การเรียนรู้เวชศาสตร์ครอบครัวและพัฒนาระบบบริการปฐมภูมิ เขตสุขภาพที่ 3 เป็นสถาบันหลักในการจัดการฝึกอบรมให้แก่แพทย์ประจำบ้านปฏิบัติงานเพื่อสอบวุฒิบัตรฯ สาขาเวชศาสตร์ครอบครัว ในเขตสุขภาพที่ 3 ตั้งแต่ พ.ศ. 2561

นับตั้งแต่ปีการศึกษา 2564 ศูนย์การเรียนรู้เวชศาสตร์ครอบครัวและพัฒนาระบบบริการปฐมภูมิ เขตสุขภาพที่ 3 ได้ทำการฝึกอบรมแพทย์ประจำบ้านตามแผนงานฝึกอบรมแพทย์ประจำบ้านแบบใช้ชุมชนเป็นฐาน (Community-Based Training) ซึ่งเป็นแผนงานฝึกอบรมที่ได้พัฒนาตามเกณฑ์การประกันคุณภาพการศึกษาของสหพันธ์แพทยศาสตร์ศึกษาโลก พ.ศ. ๒๕๕๘ (World Federation for Medical Education (WFME) ๒๐๑๕) โดยมีขอบเขตครอบคลุมพันธกิจ กระบวนการ โครงสร้าง องค์ประกอบ ผลลัพธ์หรือความสามารถที่พึงประสงค์ การประเมินผล และสิ่งแวดล้อมในการเรียนรู้ในการฝึกอบรมแพทย์ประจำบ้าน ที่มีความเชื่อมโยงและสัมพันธ์กัน เพื่อเพิ่มพูนความสามารถทางคลินิกที่มุ่งไปสู่การประกอบเวชปฏิบัติในฐานะแพทย์เวชศาสตร์ครอบครัวได้อย่างมีประสิทธิภาพ