پس از درخشش در جام جهانی، شوکر در سال ۱۹۹۹ به آرسنال پیوست، اما دوران حضورش در این تیم چندان موفق نبود. پس از آن، در تیمهای وست هم یونایتد و مونیخ ۱۸۶۰ نیز بازی کرد، اما دیگر آن مهاجم کشنده سابق نبود. او در سال ۲۰۰۳ از دنیای فوتبال خداحافظی کرد.
پس از بازنشستگی، شوکر وارد دنیای مدیریت شد و در سال ۲۰۱۲ به ریاست فدراسیون فوتبال کرواسی رسید. او در این دوران تلاش زیادی برای پیشرفت فوتبال کرواسی کرد و نقش مهمی در موفقیتهای تیم ملی این کشور در جام جهانی ۲۰۱۸ ایفا کرد.
شوکر هنوز هم به عنوان بهترین مهاجم تاریخ کرواسی شناخته میشود. آقای گلی او در جام جهانی ۱۹۹۸، درخشش در لالیگا و نقش کلیدیاش در موفقیتهای فوتبال کرواسی، باعث شده است که نامش در تاریخ فوتبال جاودانه بماند.