Clase 1 (martes 08/10/24) : Imágenes y tracking I

Palabras clave: Presentación. Microscopía. Límite de difracción. Superresolución. Señal/ruido

• Link al pdf de la clase 

• Link  al video de la clase  (comenzar en el minuto 6)

• Link al material para la realización del TP1

Clase 2 (jueves 10/10/23) : Imágenes y tracking II

Palabras clave: Algoritmos de tracking de partículas. Errores de tracking. Dependencia con la señal/ruido.

• Link al pdf de la clase

• Link al video de la clase

• Link al material para la realización del TP2

Clase 3 (martes 15/10/24) : Análisis de trayectorias (2D) I

Palabras clave: Difusión normal y difusión anómala. Regímenes de transporte. 

• Link al pdf de la clase

• Link al video de la clase

Clase 4 (jueves 17/10/24) : Análisis de trayectorias (2D) II

Palabras clave: Crowding y viscoelasticidad. Correlación de ángulos. Persistencia y procesividad. Migración celular 

• Link al pdf de la clase

• Link al video de la clase

• Link al material para la realización del TP3

Clase 5 (martes 22/10/24) : Movimiento curvilíneo I (Pasa al jueves 24/10)

Palabras clave: Descomposición trayectorias en componente paralela y perpendicular. Análisis desacoplado de la componente transversal. Elasticidad y reología del entorno.

• Link al pdf de la clase

• Link al video de la clase

• Link a códigos (Matlab)

• CLASE ESPECIAL: "Análisis cuantitativo de imágenes histopatológicas" por Dra. Ana Raimondi, Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias (IFIBYNE-UBA-CONICET). Link a la presentación y link a una imagen de prueba

• Extra (virtual asincrónico): Link a la presentación de la Dra. M. Cecilia De Rossi y al video sobre "Técnicas avanzadas de microscopía para el estudio del transporte intracelular conducido por motores moleculares"

Clase 6 (jueves 24/10/24) : Movimiento curvilíneo II  (Pasa al martes 29/10)

Palabras clave: Kymographs. Velocidad segmental. Run lengths. Gaussian mixture models. Mean residual plot analysis.

• Link al pdf de la clase

• Link al video de la clase

• Link al material para la realización del TP4

Clase 7 (martes 29/10/24) : Partículas confinadas I y II (Pasa al jueves 31/10)

Palabras clave: Distribución espacial. Mapeos. Histogramas. Clusterización. Voronoi. Interacciones entre células. 

• Link al pdf de la clase: parte I    y   parte II

• Link al video de la clase

• Extra : Tutorial MorphoLibJ preparado por Lucía Mares

Clase 8 (jueves 31/10/24) :  Filamentos I (Pasa al martes 05/11)

Palabras clave: Tracking de filamentos: algoritmos. Longitudes. Curvaturas. Longitud de persistencia.

• Link al pdf de la clase

• Link al video de la clase

• Extra: Link a AFTER: algoritmo tracking de filamentos (MATLAB)  + Link1 Filament Tracker 1 + Link2 Filament Tracker 2

Clase 9 (martes 05/11/24) : Filamentos II (Pasa al jueves 07/11)

Palabras clave: Mecánica de filamentos. Fuerzas y buckling

• Link al pdf de la clase

• Link al video de la clase

• Extra (virtual asincrónico): Link a la presentación del Dr. Alejandro Monastra (UNGS-CONICET) sobre "Modelos de filamentos semiflexibles y aplicaciones”

Clase 10 (jueves 07/11/23) : Análisis 3D de migración colectiva (VIRTUAL ASINCRÓNICO) Pasó al martes 22/10

Palabras clave: PIV, análisis morfométrico, segmentación. Clase especial dictada por la Dra. Valeria Sigot (UNER)

• Link al pdf de la clase: Análisis sobre un modelo de morfogénesis epitelial y migración celular

colectiva.

• Link al video de la clase

• Link al material de la clase especial de la Dra. Valeria Sigot. 

Clase 11 (martes 12/11/24) : Estructuras extensas 

Palabras clave: Mitocondrias y condrioma.  Retículo endoplasmático.  Caracterización geométrica y dinámica.

• Link al pdf de la clase

• Link al video de la clase

• Extra (virtual asincrónico): Link a la presentación de Joshua Godoy Coto y al video de su clase sobre "Técnicas de segmentación para imágenes histológicas"

Clase 12 (jueves 14/11/24) : Presentación de los Trabajos finales

Palabras clave: Trabajos de estudiantes.