本研討會將以下述論文獎項鼓舞有志於機構與機器原理科學領域的青年學子，從事更進一步的研究工作。
1. 研討會最佳論文獎：自投稿論文中擇選「蔡隆文教授紀念奬」、「曾錦煥教授論文紀念奬」各一與佳作數篇。
2. 優秀碩博士論文獎：相關評選辦法
3. ADAMS論文獎2名：相關辦法