Ecología Cuantitativa

DURANTE EL 2024 NO SE DICTARÁ ESTE CURSO.

Uso de R y paquetes vegan, ade4, cluster, fossil y BiodiversityR.

El programa estadístico R es cada vez más usado entre los investigadores ya que es de acceso libre y todo aquel que quiera participar del proyecto lo puede hacer. Están disponibles los protocolos de casi todos los análisis estadísticos que hoy existen, y los que no se pueden programar y luego compartirlo para que otros lo usen (lo que se conoce como inteligencia colectiva). Es decir, que es un programa que no tiene límites en cuanto a lo que puede hacer, mientras que el resto de los programas estadísticos hacen un número fijo de análisis. Entre los paquetes de R para el análisis de datos orientados al estudio de las comunidades biológicas los más utilizados son el vegan, ade4, cluster y BiodiversityR ya que proporciona la mayoría de los análisis que se necesitan. Durante este curso se espera que el alumno adquiera destrezas que le permitan usar el R de manera autónoma para que en el futuro pueda explorar y explotar todo su potencial.

Distribución de especies y su relación con los factores ambientales. ¿Cómo se relacionan las especies y los rasgos funcionales con el medio abiótico? ¿La similitud taxonómica o funcional está correlacionada con la similitud ambiental? Escuelas en ecología de comunidades y sus métodos analíticos asociados. Método fitosociológico de Braun-Blanquet. Método de los grupos florísticos de Ellenberg. Análisis de clasificación: jerárquicas, no jerárquicas, mono y politéticas, aglomerativas y divisivas. Medidas de similitud, asociación y análisis de agrupamiento usando R. Análisis indirectos de gradientes usando R: Métodos de ordenamiento (PCA, CA y NMDS). Análisis directos de gradientes usando R: Métodos de ordenamiento restringidos (RDA, CCA, CDA). Correlaciones de Mantel.

Componentes de la diversidad. La estimación de atributos de comunidades relevantes permite conocer una comunidad y cuantificar los cambios que ocurren en los ensambles relacionados con cambios en el ambiente (naturales o antrópicos). ¿Cómo estimar el número de especies que componen una comunidad? ¿Cómo se distribuyen los individuos entre las especies? ¿Cuánto afecta un disturbio antrópico al ensamble de especies nativas? ¿Cuáles son los estimadores/índices disponibles y cuál es su base conceptual? ¿Cómo selecciono el estimador más adecuado para mi estudio? Riqueza taxonómica local y regional. Similitud en la composición de especies usando R (diversidad beta). Modelos de distribución especie-abundancia. Estimación, interpretación y comparación entre comunidades. Estimación de riqueza por métodos no paramétricos y curvas de rarefacción usando R. 

Diversidad funcional y formación de ensambles. La interpretación de una especie como un conjunto de rasgos o caracteres puede ser más significativa que la riqueza o la composición taxonómica para entender una comunidad ¿Cómo se forman los ensambles de especies? ¿Cómo actúan los disturbios humanos en la formación de ensambles? ¿Cuáles son las consecuencias de los disturbios humanos (agricultura, urbanización) sobre la diversidad? ¿La diversidad taxonómica puede usarse como indicadora de la diversidad funcional? Mecanismos involucrados en la formación de ensambles a escala local y de metacomunidades. Diversidad de rasgos relacionados al nicho ecológico. Filtrado ambiental. Convergencia y divergencia de rasgos. Similitud en la composición de rasgos: diversidad beta funcional. Estimación de diversidad funcional usando R.

Diversidad funcional y procesos del ecosistema ¿Cómo y por qué cambian los procesos del ecosistema como respuesta a la pérdida (extinción) o ganancia (invasión) de especies? Las especies presentan rasgos relacionados a funciones que cumplen en el ecosistema ¿Qué factores influyen en la respuesta de los procesos del ecosistema a los cambios en la diversidad? ¿Los procesos del ecosistema responden de la misma manera a los cambios en la diversidad taxonómica y funcional? Diversidad de rasgos funcionales. Redundancia funcional. Efecto de muestreo. Complementariedad y facilitación. Experimentación. 

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