一九八七年，中華傳道會總會與前教育署幾經交涉，在青衣島獲批建新小學校舍，以延續總會的牧幼學校 (該校由於藍田屋村清拆重建之故，於一九八七年結束)。並得蒙呂明才基金及本會合共撥款七十五萬作開辦費，故易名為中華傳道會呂明才小學。

        總會邀請祐寧堂主任姚靖海牧師擔任呂小校監，姚牧師有鑑於傳福音的需要，為呂小學生、家長及青衣的坊眾傳揚福音。於一九八八年九月，由祐寧堂聘請同工擔任建堂籌備工作(並按五年資助青衣堂經費)，當時聘請何鴻偉先生擔任傳道人，並於一九八九年三月開始崇拜(祐寧堂首年差派約十位會友到青衣堂，鑽英、熾倫、鳳蘭是首年差派者；國樑、玉琴是第三個月後由母堂差派者)。

       早期青衣堂的堂委會，主要由祐寧堂執事及本堂少量弟兄擔任(包括有鄧秉翔、梁輝鴻、黃美琼等)，講員主要為總會老牧者。姚牧師於九零年移居加拿大，學校由張祖鷺牧師作校監，張牧師每兩三個月有一次到青衣堂講道。五年後約九五年，祐寧堂正式撤出青衣堂，並將本堂交回總會。

       青衣堂於1999年成立執事會，首屆執事為：黃國樑、吳錦輝，梁翠玲，謝淑婉、朱美華、區永廉、戴維愛。

​      教會事工包括，傳道差傳部、兒童事工部、培育部、團契部、敬拜部及總務部。現有聚會包括八個團契、兒童主日學及崇拜、成人主日學及崇拜、隔週三晚祈禱會、主日晨更祈禱會、讚美操活動。