Conforme a lo estipulado en el Articulo 8 de la Ley Provincial N°14.581, el C.E.I.M.S. cuenta con tres órganos principales, los cuales son:
Comisión Directiva
Integrada por cuatro personas, las cuales ocupan los cargos de: Presidente, Vicepresidente, Secretario General y Secretario de Relaciones Institucionales. Son elegidos una vez por año, en las elecciones del Centro de Estudiantes. Son encargados de llevar a cabo las actividades que impulse el C.E.I.M.S.
Asamblea General
Es el órgano inapelable para la toma de decisiones, integrado por la totalidad de los estudiantes y presidido por el Vicepresidente. Esta asamblea será convocada para trabajar temas de relevancia y/o urgencia.
Cuerpo de Delegados
Integrado por 24 delegados (dos por curso), elegidos al inicio del ciclo lectivo por sus compañeros. Su función es doble, tanto en la representación de sus cursos como el la participación en la presentación, proyección y organización de propuestas del C.E.I.M.S.
Además de los órganos principales, el C.E.I.M.S. cuenta con 3 órganos auxiliares con el fin de garantizar el cumplimiento de las normas y metas de nuestro Centro de Estudiantes. Estos órganos auxiliares son:
Secretarías
Su función es colaborar directamente con la Comisión Directiva para la realización de los proyectos y actividades. Las secretarías serán designadas o eliminadas directamente por quien sea Presidente.
Junta electoral
Este órgano trabaja sobre el Código Electoral, estando presente en la organización, provisión, desarrollo y concreción de la elección.
Tesorería
Administra los fondos del Centro de Estudiantes, en caso de que haya previsión de gastos.