วัณโรคดื้อยา เกิดจากผู้ที่เคยป่วยเป็นวัณโรคแล้วรักษา อย่างไม่ถูกต้อง คือหยุดยาก่อนกำหนดที่จะรักษาครบระยะ หรือรักษาไม่สมำ่เสมอ จนทำให้เชื้อวัณโรคพัฒนาขึ้นให้ทนต่อ ยาที่เคยรักษา จึงไม่สามารถที่จะรักษาได้ด้วยยาเดิมที่เคยใช ้