데이터과학연구소는 관련 분야의 연구 활동을 폭넓게 망라함과 동시에 보다 전문화된 연구 활동을 전개하기 위한 연구부 체계로 조직된다.
연구부는 통계 교육상담부, 품질데이터연구부, 생물통계연구부, 데이터마이닝연구부의 4개로 구성되며, 조직은 소장1인, 간사1인, 연구위원 12인(소장 및 간사 포함), 그리고 선임연구원, 연구원, 객원연구위원으로 구성된다.