Breve historia. Hasta el año 1999, las dos unidades de Fe y alegría, José Miguel Lanza (turno mañana) y Gregorio Lanza (turno tarde), atendían únicamente hasta octavo curso; toda la secundaria cursaban en la unidad educativa Don Bosco.
El número de estudiantes por cursos seguía en aumento. Pues, ese año, sólo el alumnado de los octavos cursos de Fe y Alegría alcanzó a 80. Esto causó preocupación a las direcciones de Fe y Alegría y Don Bosco; sobre todo a las autoridades de Don Bosco, pues los estudiantes rebasaban las aulas.
Entonces, para dar una solución temporal, la Hermana Verena Birnbacher ofreció dos aulas en los predios de Fe y Alegría; el director de la unidad educativa Don Bosco (padre Fernando Urakuminl) no aceptó la propuesta; sin embargo, planteó una pregunta: “¿Por qué Fe y Alegría no puede tener su propia secundaria?”. La Hermana (directora del Núcleo y coordinadora de Fe y Alegría) no contestó a esta interrogante, pues ella siempre quería tener una buena primaria; vale decir, prestar servicio educativo a toda la primaria lo mejor que se pueda, y no estaba en sus planes, crear el nivel secundario.
Pero la pregunta del director rebasó las paredes de las direcciones. Tanto padres de familia y profesores se mostraron muy entusiastas. Razón por la cual, se formó una comisión y ésta se reunió con la coordinadora de Fe y Alegría Cochabamba, Lic. Jael Rodríguez, para tratar el caso. Ella no se mostró tan entusiasta como los de la comisión, quería tratar el tema con mucha cautela.
Al fin, la Hermana Verena Birnbacher (Directora de la Unidad Educativa José Miguel Lanza, hasta entonces) y algunos profesores dijeron: “Haremos la prueba”. Para el comienzo del año 2000 se mostraron 50 interesados en matricularse, de los cuales sólo 40 efectivizaron su inscripción. Ese año la nueva unidad educativa sólo contó con 2 ítems, el resto fue saldado con pago particular.
Los trámites para la creación de la nueva unidad educativa se lograron rápidamente, gracias al esfuerzo constante del Prof. Francisco Lafuente, ex director distrital de Independencia. La resolución de la Unidad Educativa “Técnico Humanístico Boliviano Alemán” fue entregada el 2 de agosto del año 2000.
El año 2001 se presentó un escrito a la Honorable Alcaldía Municipal de Independencia solicitando el terreno para la construcción de la nueva infraestructura de la unidad educativa, pues las tres aulas de calamina fueron colapsadas. La solicitud fue aceptada.
En principio, se pensaba construir algo pequeño, pero don Enoc Crespo, Presidente de la Junta Escolar de ese año, sugirió una construcción grande, la sugerencia fue aceptada. De esa manera se construyó el bloque con 10 aulas, cinco aulas en planta baja y cinco en el primer piso.
La nueva construcción se hizo realidad gracias a la donación alemana: Missions Kreais Ayopaya, Hermanas de las Cáritas y algunos amigos del mismo país. Así fue escalando año tras año con los otros cursos gradualmente. Para el año 2003, la primera promoción se graduó con 28 bachilleres.