植物病原菌は感染成立を試みる際、植物細胞壁分解酵素（ヘミセルラーゼやペクチナーゼ）を含む病原性タンパク質群を分泌し、攻撃します。一方植物は病原菌の細胞壁成分であるキチンやグルカンといった多糖を分解する酵素（キチナーゼやグルカナーゼ）を分泌し、分解・溶菌をもたらすことによって抵抗性を示します（攻めの抵抗性）。さらに相手側から分泌される酵素群を無力化する（迎撃する）ことができる阻害タンパク質を分泌して、自らを守ります（守りの抵抗性）。この様に植物と病原菌の攻防は、両者の境界面で繰り広げられる分泌タンパク質同士の分子レベルでの攻防と見ることもできます。本研究では関連するタンパク質、特に植物の生体防御タンパク質であるPR proteins（Pathogenesis-Related Proteins）に注目し、両者のバトルの実体をとらえ、詳細を可視化し、理解したいと考えています。新たな環境循環型の品種や農薬の開発に寄与することを目的としています。

　第3の生命鎖である糖鎖には単純なものから、複雑なものまで様々な種類があります。その多様性は3つの鎖（核酸、タンパク質、糖鎖）の中では最大で、それだけに生物にとって重要な分子であることがうかがわれます。例えば特定の構造をもつ糖鎖は、プレバイオティクスとして腸内環境を整えたり、酵素の阻害剤となる糖鎖は抗ウィルス薬になるなど、実際にある生物を制御する力を発揮することもあります。私たちは天然の糖鎖もしくは少し人工的に手を加えた糖鎖をプローブ（探針）として利用し、糖鎖に関わる酵素やタンパク質の機能を調べています。また、新しい糖鎖の酵素合成法の確立も試みたりしています。 このような切り口から、植物、動物、微生物と、対象を限定せずに糖鎖の関わる様々な生物学（グライコバイオロジー）に新たなページを加えることを目指しています。

　日本人の約4人に1人が悩まされていると言われる花粉症は、花粉に含まれるタンパク質が原因となっています。花粉の細胞中には100種類以上のタンパク質が含まれていますが、その中で幾つかのタンパク質が花粉症の引き金（アレルゲン）となっていることがわかっています。しかし、どのような構造を持つタンパク質がヒトにとってアレルギーを引き起こすのか、まだわかっていません。私たちはスギ花粉アレルゲンに代表されるアレルゲンタンパク質に焦点を当て、それらの立体構造決定を一つ一つ明らかにすることにより、この謎に迫りたいと考えています。また、近年注目されている食物アレルギーとの関連性にも興味をもっています。