2004 m. buvo įkurta asociacija (vok. Verein) „Lietuviška mokyklėlė“.
Nuo 2014 m. buvo stebėtas menkas tėvų aktyvumas. Mokyklėlės susitikimus lankydavo vos 4-7 mokiniai, mokykla neturėjo mokytojų. Asociacija panaikinta.
Nuo 2017 m. mokyklėlė veikė prie Berlyno Lietuvių Bendruomenės (BLB) savanoriškais, tėvelių iniciatyvos pagrindais, be atskiro juridinio asmens statuso.
2018–2019 m. m. mokyklėlę lankančių vaikų skaičius išaugo iki 30.
2020 m. mokyklėlėje užregistruoti 36 vaikai: iš jų 21 ikimokyklinio amžiaus ir 15 mokyklinio amžiaus. Dėl Covid-19 pandemijos susitikimai vyko tik lauke.
Tuo tarpu mokytojos aktyviai pasinaudojo proga dalyvauti nuotoliniuose mokymuose, finansuotose ŠMM užsienio lietuvių neformaliojo lituanistinio švietimo ir sporto projektų.
2021 – 2023 m. mokyklėlė tęsė veiklą, turėdama apie 35 registruotus vaikus. Didesnis vaikų skaičiaus deja nelabai galimas dėl patalpų.
2023 rudenį vėl įkurta asociacija (vok. Verein) „Berlyno Lietuvių Mokyklėlė“ siekiant užtikrinti organizacijos stabilumą, finansinę nepriklausomybę ir paprastenį projektų administravimą. Nuo 2023 m. mokyklėlė ir jos vaikai yra registruoti Mokinių Registre.
nuo 2023 m. mokyklėlė gauna ŠMSM finansinę lituanistinio švietimo programų finansavimo ir vykdymo paramą.