โรงเรียนบ้านขลอด เดิมชื่อโรงเรียนประชาบาลตำบลสัตหีบ ก่อตั้งขึ้นเมื่อ 

วันที่ ๒๓ พฤษภาคม พ.ศ. ๒๔๘๒ โดย นายชุมพล อุทยานิก นายอำเภอสัตหีบ ได้ดำเนินการก่อตั้งขึ้นด้วยความร่วมมือของชาวบ้านอ่าวขลอดเพื่อให้ลูกหลานได้มีที่เรียนหนังสือ แต่เดิมตั้งอยู่ที่ริมทะเลอ่าวขลอด หมู่ ๒ ตำบลสัตหีบ กิ่งอำเภอสัตหีบ จังหวัดชลบุรี

• พ.ศ. ๒๔๘๙ ย้ายโรงเรียนมาตั้งที่ริมถนนสุขุมวิท กิโลเมตรที่ ๗ (หลักกิโลเมตรเดิม) ด้วยเหตุผลที่ว่าประชาชนได้อพยพไปอยู่ที่อื่นมากขึ้น เนื่องจากกันดารน้ำและการคมนาคมไม่สะดวก ทำให้มีเด็กเข้าเรียนน้อย นายสงบ ศรีประพัฒน์ ผู้ใหญ่บ้านหมู่ ๔ ตำบลสัตหีบในขณะนั้น ได้บริจาคเงินและที่ดิน จำนวน ๖ ไร่ ๓ งาน ริมถนนสุขุมวิท ติดกับวัดราษฎร์สามัคคี กม.๑๐ ให้สร้างโรงเรียนขึ้น จึงเป็นที่ตั้งของโรงเรียนในปัจจุบัน และเปลี่ยนชื่อเป็นโรงเรียนเป็น โรงเรียนบ้านขลอด ตั้งแต่นั้นมา

• พ.ศ.๒๕๐๙ โรงเรียนโอนไปสังกัดองค์การบริหารส่วนจังหวัดชลบุรี

• พ.ศ.๒๕๒๓ โรงเรียนโอนไปสังกัดคณะกรรมการประถมศึกษาแห่งชาติ กระทรวงศึกษาธิการ

• พ.ศ.๒๕๔๔ ปีการศึกษา ๒๕๔๔ โรงเรียนบ้านขลอดได้เปิดขยายโอกาสทางการศึกษา โดยเปิดการสอนระดับชั้นมัธยมศึกษาตอนต้น

                 -  ปีการศึกษา ๒๕๔๔ เปิดสอนชั้นมัธยมศึกษาปีที่ ๑

                 -  ปีการศึกษา ๒๕๔๕ เปิดขยายชั้นมัธยมศึกษาปีที่ ๒

                 -  ปีการศึกษา ๒๕๔๖ เปิดขยายชั้นมัธยมศึกษาปีที่ ๓

• พ.ศ.๒๕๔๖ โรงเรียนโอนไป สังกัดคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน กระทรวงศึกษาธิการ เขตพื้นที่การศึกษา ชลบุรี เขต ๓

• พ.ศ.๒๕๔๗ ปีการศึกษา ๒๕๔๗ โรงเรียนบ้านขลอดได้โอนการศึกษาระดับมัธยมศึกษาไปรวมกับโรงเรียนพลูตาหลวง ตำบลพลูตาหลวง อำเภอสัตหีบ

     จังหวัดชลบุรี

• ปัจจุบัน ขึ้นตรงกับ สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาชลบุรี เขต ๓ 

สังกัดสำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน กระทรวงศึกษาธิการ