4 mặt Đông, Tây, Nam, Bắc của xã Nguyên Khê đều có sự tiếp giáp với các xã, thị trấn khác trong huyện. Phía Đông là xã Xuân Nộn, phía Tây là xã Bắc Hồng, phía Nam là xã Tiên Dương và thị trấn Đông Anh và phía Bắc là xã Phù Lỗ và xã Phú Minh (huyện Sóc Sơn). Nhờ sự tiếp giáp ấn tượng này mà cư dân trong xã dễ dàng kết nối với các xã trong huyện và ngoài huyện.
Toàn xã Nguyên Khê chia thành các thôn: Cán Khê, Đại Bằng, thôn Đồng, Khê Nữ, Lâm Tiên, Nguyên Khê, Sơn Du và Tiên Hùng. Trên địa bàn xã là khu công nghiệp Nguyên Khê, lô A. Cùng với đó là hệ thống giao thông hiện đại và phát triển như quốc lộ 3, đường AH14 đi qua nhằm kết nối với các đơn vị hành chính lân cận. Nội xã là đường Lê Hữu Tựu và đường Nguyên Khê giúp liên thông các thôn thuận lợi.
Quy hoạch chi tiết rõ ràng xã Nguyên Khê
Từ năm 2018, UBND thành phố Hà Nội đã ra quyết định về việc quy hoạch các thôn Cán Khê, Tiên Hùng, Lâm Tiên, Nguyên Khê, Khê Nữ và thôn Đồng thuộc xã Nguyên Khê thành phân khu đô thị N5. Quy hoạch chung xây dựng thủ đô đến năm 2030 và tầm nhìn đến năm 2050 cho phép việc quy hoạch cục bộ xã Nguyên Khê thành một phần của trung tâm thương mại, kinh tế tại phía Bắc Hà Nội. Không chỉ đầu tư đất về dịch vụ công cộng, thương mại dịch vụ mà quỹ đất tại đây còn đáp ứng đầy đủ về văn hóa, giao thông, cây xanh. Vì thế, nếu trở thành cư dân trong tương lai tại Nguyên Khê Đông Anh, bạn sẽ được hưởng trọn vẹn tất cả tiện ích cao cấp.