El "combustible" de las plantas de biogás suele ser excrementos de animales (purines) o, como es el caso de la planta de Cubas de la Sagra, comida podrida, pasada de fecha, o desechada por supermercados y grandes superficies.

Después de triturar, pasteurizar y mezclar, se deja que se descomponga durante un tiempo en un tanque en el que se generarán unos gases debido a la descomposición (metano y dióxido de carbono).

Los gases resultantes pasan a hacia un sistema de almacenamiento, de generación o motores, que transforman el biogás en energía eléctrica o calor. Los desechos de materia orgánica se expulsan y utilizan, por ejemplo, como abono para agricultura.