По среде обитания они делятся на сетевые, файловые, загрузочные и файлово –загрузочные вирусы.
По способу заражения – на резидентные и нерезидентные вирусы.
По степени опасности – на неопасные, опасные и очень опасные вирусы.
По особенностям алгоритма – на вирусы-компаньоны, паразитические вирусы, репликаторы (черви), невидимки (стелс), мутанты (призраки, полиморфные вирусы, полиморфики), макро-вирусы, троянские программы.
По целостности – на монолитные и распределенные вирусы.