Ouvrir des données en python

• Changer le répertoire source et l'afficher : on peut ainsi se dispenser d'indiquer le chemin complet d'un fichier lorsqu'on voudra l'ouvrir mais uniquement son nom.

import os as os

os.chdir("C:/Users/apcma/Google Drive/IUT/LP") # remplacer \ par /

print("Current Working Directory " , os.getcwd())

• Ligne de code à coller dans la console windows pour installer les modules nécessaires

python -m pip install --user easygui pandas

• pandas, permet de gérer les data.frames (tableaux de données classiques type base de données ou tableur Excel)

• easygui, permet d'ouvrir automatiquement une fenêtre pour aller chercher le fichier là où il est

• Ouvrir un tableau excel au format data.frame avec le module pandas

import easygui

import pandas as pd

df2 = pd.read_excel(easygui.fileopenbox()) # On peut remplacer easygui.fileopenbox() par le nom du fichier.

# équivalent de la fonction file.choose() de R

Remarque : pensez à l'argument skiprows pour sauter les premières lignes du tableau si elles sont vides ou non pertinentes.

• Ouvrir un fichier texte avec pandas

import easygui ; import pandas as pd

df2 = pd.read_table("C:/mon_fichier.txt")

• Ouvrir un fichier CSV avec pandas

import easygui ; import pandas as pd

df2 = pd.read_csv("C:/mon_fichier.csv")

• Ouvrir le fichier en sautant la première ligne

df2 = pd.read_csv("C:/mon_fichier.csv",skiprows=[0])

• Charger des données de type texte avec numpy

import numpy as np

data = np.loadtxt(easygui.fileopenbox()) # On peut remplacer la partie en gras par le nom du fichier

• Ouvrir un autre format avec pandas (html, sas...)

import pandas as df

dir(df) # Toutes les commandes commençant par read permettent d'ouvrir un fichier : on peut donc ouvrir html, sas...

• Ligne de code à coller dans la console windows pour installer les modules nécessaires

python -m pip install --user xlrd easygui

• xlrd, permet de gérer les tableaux excel de tous les format

• easygui, permet d'ouvrir automatiquement une fenêtre pour aller chercher le fichier là où il est

1) Ouvrir le tableau excel

import easygui ; import xlrd

document = xlrd.open_workbook(easygui.fileopenbox())

2) Décrire le tableau ainsi ouvert

print("Nombre de feuilles: "+str(document.nsheets))

print("Noms des feuilles: "+str(document.sheet_names()))

feuille_1 = document.sheet_by_index(0) # Récupérer la feuille (onglet) 1 du tableau

print("Format de la feuille 1:")

print("Nom: "+str(feuille_1.name))

print("Nombre de lignes: "+str(feuille_1.nrows))

print("Nombre de colonnes: "+str(feuille_1.ncols))

3) Afficher le contenu d'une cellule

feuille_1 = document.sheet_by_index(0)

cellule = feuille_1.cell_value(rowx=1, colx=3)

print(cellule)

4) Afficher les titres des colonnes en définissant où les trouver

feuille_1 = document.sheet_by_index(0) # Récupérer la feuille (onglet) 1 du tableau

cols = feuille_1.ncols # Nombre total de colonnes

rows = feuille_1.nrows # Nombre total de lignes

# Affichage des titres : ici dans la première ligne

for titre in range(cols) :

titre = feuille_1.cell_value(rowx=0, colx=titre)

print(titre)

5) Récupérer les valeurs d'une petite colonne grâce à une petite fonction que l'on nommera ici colonne

# La fonction colonne va récupérer toutes les lignes (rows) d'une colonne donnée (col) pour un tableau (tableau)

def colonne(col, tableau, rows):

liste_temp = []

for ligne in range(1,rows,1) :

liste_temp.append(tableau.cell_value(rowx=ligne, colx=col))

return liste_temp

# Exemple d'utilisation

hematies = colonne(1, feuille_1, rows) # rows ici indique le nombre max de lignes. cf. 4) ci-dessus. On peut mettre une valeur plus petite

vgm = colonne(2, feuille_1, rows)

Remarque, cet exemple fonctionne avec le jeu de données 11 disponible dans la rubrique database du site Aide à l'utilisation de R.