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これはアジレント・テクノロジー株式会社でデザインし、お客様に公開しているアレイです。
C.griseus_Refseq2015アレイ デザインID:077089
C.griseus(チャイニーズハムスター)アレイは2015年7月のNCBI Refseqデータベースから抽出した21763 Protein-coding genesの56105 Transcriptsに対してプローブを設計しました。フォーマットは8x60kです。
MacFas_Refseq_mRNA_2015アレイ デザインID:075606
M.fascicularis(カニクイザル)アレイは2015年のNCBI Refseqデータベースから抽出した21133 Protein-coding genesの58659 Transcriptsに対してプローブを設計しました。フォーマットは8x60kです。
Kaiko_Refseq2015アレイ デザインID:080322
Bombyx mori(カイコ)アレイは2015年12月のNCBI Refseqデータベースから抽出した、13722 Protein-coding genesの19623 Transcriptsに対してプローブを設計しました。1プローブに対し3回のスポットしており、平均値を使うことでデータが安定します。フォーマットは8x60kです。
Ensembl87_marmoset_8x60kアレイ デザインID:084626
C.jacchus(マーモセット)アレイは2017年1月のEnsemblデータベースから抽出した31900 Protein-coding genes+Non-coding genesの54679 Transcripsに対してプローブを設計しました。フォーマットは8x60kです。
Medaka4x44_Refseq_201608 デザインID:084306
Medaka8x60_Refseq_201608 デザインID:084307
O. latipes(メダカ)アレイは2016年8月のNCBI Refseqデータベースから抽出した22499 Protein-coding genes+Non-coding genseの34460 Transcripsに対してプローブを設計しました。フォーマットは4x44kと、8x60kの2種類が存在します。
Spirodela_polyrhiza8x60 デザインID:084308
Spirodela_polyrhiza(水草の1種)アレイは2016年8月のJGIデータベースから抽出した19619 Targetsに対してプローブを設計しました。フォーマットは8x60kです。
Human_blood_circulatory_system_4x44k デザインID:084319
Human_blood_circulatory_system_8x60k デザインID:084310
Human_blood_circulatory_system(ヒト循環器系遺伝子)アレイはSurePrint G3 Human GE v3 8x60K Microarray(072363)から循環器系に関する3064Genesのみを抽出しました。4x44kフォーマットは同じプローブを9回繰り返しスポットしています、8x60kは14回繰り返しています。
Human_Protein-coding_4x44k2 デザインID:084340
Human_Protein-coding_8x60k デザインID:084312
Human_Protein-coding(ヒト)はSurePrint G3 Human GE v3 8x60K Microarray(072363)からタンパク質をコードする19033Genes 22361Transcriptsのみを抽出しました、8x60kフォーマットでは同じプローブを2回以上繰り返しスポットしているので安定したデータが得られます。
Bos Taurus_ensembl_201704 デザインID:084825
Bos Taurus(ウシ)アレイは2017年4月のEnsemblから抽出した25990Transcriptsに対してプローブを設計しました。フォーマットは8x60kです。
Ensembl_galgal5_201706 デザインID:084914
G. gallus(ニワトリ)アレイは2017年6月のEnsemblから抽出した26819Transcriptsに対してプローブを設計しました。フォーマットは8x60kです。
Ensembl_neko_201706 デザインID:084922
Ensembl_neko_201706_4x44v2 デザインID:085008
Felis catus(ネコ)アレイは2017年6月のEnsemblから抽出した19932Genesの19932Transcriptsに対してプローブを設計しました。フォーマットは8x60kと4x44kの2種類です。
ArabidopsisV4 Gene Expression Microarray_8x60k デザインID:085076
ArabidopsisV4 Gene Expression Microarray_8x60kはカタログアレイを8x60kフォーマットで再作成しました。
Daizu_20171011 デザインID:085125
G. max(ダイズ)アレイは2017年11月のphytozomeデータベースから抽出した79890Transcripsに対してプローブを設計しました。フォーマットは4x180kです。
HDN_refseq_201803 デザインID:085425
H. glaber (ハダカデバネズミ)アレイは2018年3月のNCBI Refseqデータベースから抽出した26576Genes、36685Transcriptsに対してプローブを設計しました。フォーマットは8x60kです。