La Asociación Boliviana de Paleontología tiene como misión la promoción, protección y defensa de las actividades paleontológicas en el territorio nacional, entendiendo por estas actividades la protección del Patrimonio Natural Paleontológico, la preservación del mismo y las colecciones existentes, investigar y divulgar conocimiento paleontológico dentro de las normas del conocimiento científico, ético y responsable.
La defensa del Patrimonio Natural Paleontológico, en el entendido de que forman parte de dicho Patrimonio los organismos o parte de organismos o indicios de la actividad vital de organismos que vivieron en el pasado geológico y toda concentración natural de fósiles en un cuerpo de roca o sedimentos expuestos en la superficie o situados en el subsuelo del territorio nacional boliviano.
La promoción, incentivo y el apoyo a la capacitación, especialización, mejoramiento profesional e integral en el ámbito de las actividades paleontológicas de sus afiliados (curación de ejemplares, determinación sistemática de paratipos, holotipos, lectotipos y otros, museografía, inventariación de los fósiles, estudio de placas palinomórficas, elaboración de cuadros estratigráficos, cronoestratigrafía, bioestratigrafía, obtención de moldes, tramitaciones para muestras fósiles en el exterior, integración de datos con objetivos paleogeográficos, etc.).