BoBoiBoy adalah karakter utama dan eponim dalam seri BoBoiBoy dan BoBoiBoy Galaxy. Ia lahir pada tanggal 13 Maret dan merupakan seorang pahlawan elemental muda dari Bumi. BoBoiBoy berasal dari Pulau Rintis dan mendapat kekuatan dari Ochobot. BoBoiBoy memiliki 7 kekuatan elemen, yaitu Petir, Angin, Tanah, Api, Air, Daun, dan Cahaya. BoBoiBoy memiliki sifat pemberani, tangguh, dan bertanggung jawab. Tugas BoBoiBoy adalah melindungi Bumi, melindungi Galaksi dan juga menyelamatkan Power Sphera.

Serjarah Awal: BoBoiBoy adalah seorang anak laki-laki yang tinggal di Kota Hilir bersama ibu dan ayahnya. Ayahnya bekerja sebagai duta besar. Selama satu musim liburan, BoBoiBoy kembali ke Pulau Rintis dan bertemu kembali dengan kakeknya, Tok Aba. Lalu BoBoiboy bertemu Ochobot. Dia diberikan jam kuasa yang dapat membuat nya bisa menguasai banyak elemen. Disinilah petualangan BoBoiBoy sebagai superhero dimulai. 

Yaya adalah salah satu tokoh fiktif dalam serial animasi BoBoiBoy Ia berperan sebagai teman dari BoBoiBoy juga tetangganya Tok Aba yang memiliki kemampuan untuk memanipulas gravitasi, yang memungkinkan dia untuk mengontrol gravitasi dan terbang. Yaya lahir pada 5 Agustus. Yaya suka membuat kue dan membagi kuenya kepada orang lain tetapi orang lain terkadang menolaknya karena kuenya yang tidak enak yang membuat orang lain pingsan. Yaya adalah seorang gadis yang manis, mesra dan ceria, tetapi mudah kecil hati. Dia juga seorang anak perempuan yang prihatin dan selalu memberi nasihat kepada kawan-kawannya dan orang lain tidak kira dalam apa-apa situasi pun. Dia juga suka menolong orang dan tidak suka apabila kawan-kawannya menolak pertolongannya. Yang paling kurang menyenangkan orang.

Gopal adalah teman baik BoBoiBoy yang selalu mendukung teman-temannya. Gopal sangat suka pada makanan, terutama cokelat khusus Tok Aba. Oleh karena itu, Gopal memiliki kekuatan manipulasi molekul, yang memungkinkan dia untuk mengubah objek menjadi apa saja sesuai kehendaknya, tetapi karena dia terobsesi dengan makanan maka dia selalu mengubah sesuatu menjadi makanan. Gopal lahir pada 20 Juni. Gopal adalah seorang anak yang paling hyperaktif dibandingkan yang lainnya, khususnya ketika dia mempromosikan gerai Tok Aba's Kokotiam ke BoBoiBoy pada Musim 1, Episode 1 dan mencoba menyelamatkan penduduk setempat meskipun masih lagi tidak mengetahui jenis kuasanya pada Musim 1, Episode 2. Badannya yang besar tidak menyembunyikan sifatnya yang mudah gentar atau takut dibandingkan dengan teman-temannya, tetapi rasa takut ini berguna untuk Gopal menggunakan kekuatannya dan menjadi seorang pahlawan yang berguna.

Ying adalah adalah salah satu tokoh fiktif dalam serial animasi BoBoiBoy. Ia seorang gadis ceria yang juga merupakan sahabatnya Yaya. Mereka selalu bersaing dalam setiap aspek tetapi tidak mempengaruhi persahabatan mereka. Ying memiliki kekuatan untuk memanipulasi waktu dan memungkinkannya untuk bergerak dari satu tempat ke tempat yang lain dengan cepat. Ying lahir pada 16 Desember. Ying adalah seorang yang pemalu tetapi setelah mendapat kekuasaan, dia menjadi seorang yang berani. Dia juga seorang yang berusaha bersungguh-sungguh dalam bidang pertandingan dan ujian, terutama dengan pesaing ketat peperiksaannya yaitu sahabatnya, Yaya. Meskipun perwatakannya selalu berubah-ubah, namun dia tetap fokus dalam setiap pertandingan dan pertarungan. Dia akan berusaha untuk membantu teman-temannya yang berada dalam kesusahan.

Fang adalah salah satu tokoh fiktif dalam seri animasi BoBoiBoy. Ia seorang teman dan mantan musuh BoBoiBoy. Meskipun tetap bersaing dengan BoBoiBoy tetapi dia bersedia untuk membantunya ketika masalah datang. Dia memiliki kekuatan untuk memanipulasi bayang, dan mampu untuk menghasilkan bayang yang berbentuk hewan untuk digunakan di dalam pertarungan. Dia juga memiliki banyak pengalaman dibandingkan teman-temannya yang lain. Fang lahir pada 13 April. Fang adalah Alien yang berwujud seperti manusia. Fang adalah seorang pria yang agak sombong, mementingkan diri, tidak suka bersosialisasi dan juga lebih suka menyendiri. Dia adalah seorang manusia yang suka menjaga kebersihan. Semenjak dia pindah ke Sekolah Rendah Pulau Rintis, dia menjadi kesukaan banyak, terutama murid perempuan karena kekacakannya, tetapi setiap kali nama BoBoiBoy disebut dan dipuji, murid-murid mudah tertarik kepada kisah BoBoiBoy sehingga membuat Fang merasa cemburu dan iri hati. Di BoBoiBoy Galaxy, Fang sudah cukup matang. Dia tidak lagi membawa persaingan, cemburu, atau kebenciannya pada BoBoiBoy. Dia kini dewasa sebagai pemimpin, karena dia telah ditugaskan sebagai kapten tim terorganisir serta pemimpin timnya sendiri. Fang juga tumbuh cukup trendi, karena dia mengenakan helm jamur yang sangat modis karena ini adalah tren mode baru.

Qually adalah karakter baru dalam seri BoBoiBoy Galaxy Musim 2 yang berperan sebagai tritagonis utama. Dia menyamar sebagai anak murid kepada Tuan Guru Gaharum saat bertemu dengan BoBoiBoy dan teman-temannya. Pada penampilan pertamanya, Qually terlihat berani, ramah dan protektif terhadap BoBoiBoy dan teman-temannya. Namun, Qually diturunkan menjadi alien yang egois, licik, dan serakah karena putus asa mencari empat bahan tersebut sehingga layak belajar dengan Gaharum. Meski sering meremehkan BoBoiBoy dan kawan-kawan, ia tetap cerdas dan mampu membuat rencana dengan cepat tanpa digagalkan sehingga memungkinkannya kabur bersamanya. Ia bersikap seperti itu karena bercita-cita menjadi koki sejak kecil, namun tidak mendapat izin dari orang tuanya. Setelah kompetisi memasak, dia sekarang berhubungan baik dengan BoBoiBoy dan teman-temannya dan meminta maaf karena membiarkan obsesinya menguasai dirinya. Dalam Berjuan Tanpa Gentar!, dia juga terungkap memiliki sifat pengecut, sama seperti Gopal. Dia sering menyelamatkan BoBoiBoy Gentar dari bahaya sepanjang edisi ini dan seterusnya.