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La bottiglia di Niskin è un contenitore di plastica che utilizziamo per il campionamento di acqua in profondità. Si tratta di una bottiglia aperta in entrambe le estremità con dei tappi azionati a distanza meccanicamente mediante un contrappeso detto messaggero. Per favorire l'immmersione della bottiglia si attacca alla sua estremità un peso.
Innanzitutto la bottiglia deve essere armata, ovvero bisogna sistemare il meccanismo che ne permette la chiusura in seguito all'arrivo del messaggero. Si lega la bottiglia al verriccelo e si immerge fino alla profondità desiderata. Successivamente, si fa cadere il messaggero lungo il cavo di immersione e si aspetta che la bottiglia si chiude. Infine, essa viene riportata in superficie tramite il verricello e si può proseguire con le analisi
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