La Maestría en Ciencias en Ingeniería Ambiental tiene una duración de dos años, organizados en semestres de 16 semanas. Para obtener el grado, el estudiante deberá cubrir un mínimo de 96 créditos, que incluyen cursos, seminarios y la elaboración y defensa de la tesis. En caso de no concluir dentro del plazo establecido, el Coordinador General de la MCIA, con base en la opinión del tutor académico y del Consejo Académico, podrá autorizar la reinscripción conforme al Artículo 46 del Reglamento General de Estudios de Posgrado (RGEP). Los casos que excedan este periodo serán evaluados por el Consejo Académico.