La Facultad de Agricultura e Investigación Agrícola tomó su nombre de la reconocida cafetalera Sra. Julia Hill de O´Sullivan. Inició sus labores como Escuela de Agricultura e Investigación Agrícola el 3 de marzo de 1981 con la Licenciatura en Tecnología Agroindustrial.
En 1988 se gestionó para convertirla en Facultad con la carrera de Ingeniería Agroindustrial, y dos carreras técnicas: el Técnico en Cultivos Agroindustriales y el Técnico en Procesos y Conservación de Alimentos. La Ingeniería en Alimentos fue aprobada en agosto de 1991.
Durante su vigencia la Facultad ha trabajado con cuatro estructuras de pénsum en Ingeniería Agroindustrial e Ingeniería en Alimentos. Los actuales pénsums fueron aprobados el 3 de diciembre de 2001 para Ingeniería Agroindustrial, el 17 de septiembre de 2001 para la Ingeniería en alimentos, cada uno contiene 53 materias con una duración de 5 años.
La Ingeniería en Agrobiotecnología con pénsum aprobado inició en el ciclo 01-2014 y la Ingeniería en Gestión Ambiental aprobada a partir del ciclo 01-2016.