Honda D., Okumura M., Oi A., Sakuma C., Obata F., Ando T., Miura M., Chihara T. “The Hippo tumor suppressor pathway triggers non-cell autonomous tumorigenesis in Drosophila” EMBO Reports (2026)
広島大学からのプレスリリースはこちら．EMBO Reports内での説明記事”News & Views”にも取り上げていただきました。
Loer CM, Yim H, Geiger LT, Ramadan YH, Hampton MF, Bernal DV, Carstensen HR, Morgan J, Rivard L, Medina T, Cook SJ, Okumura M, Lightfoot JW, Hobert O, Hong RL "Identity and functions of monoaminergic neurons in the predatory nematode Pristionchus pacificus reveal nervous system conservation and divergence" eLife 15:RP109557 (2026)
Ishita Y., Hiraga H., Chihara T., Okumura M., “Characterization of heat shock protein expression and its application to temporal gene expression in the nematode Pristionchus pacificus” Development Growth and Differentiation 68, e70045 (2026)
進化発生遺伝学のモデル線虫Pristionchus pacificusで、熱ショック依存的に発現変動する遺伝子の網羅的解析を行いました。また、このデータを用いて、本種で初となる時間的遺伝子発現実験の手法を開発しました。本種における時期特異的な遺伝子機能の解析に活用されることが期待されます。
Eren,GG., Böger, L., Roca, M., Hiramatsu, F., Liu, J., Alvarez, L., Goetting, DL., Cockram, LA., Zorn, N., Han, Z., Okumura, M., Scholz, M., Lightfoot, JW. “Predatory aggression evolved through adaptations to noradrenergic circuits”, Nature 651, 154-163 (2026)
紹介Youtube
プレスリリース（英語）
Ukita, Y., Suzuki, R., Miyoshi, K., Saito, K., Okumura, M., Chihara, T., “Generation of Odorant Receptor-QF2 Knock-In Drivers for Improved Analysis of Olfactory Circuits in Drosophila“, Genes to Cells, 30, e70028 (2025)
Manabe, A., Ko, K., Nakayama, K., Chihara, T., Okumura, M., “The Nematode Pristionchus pacificus Requires the Gβ and Gγ Proteins for Light Adaptation But Not For Light Avoidance”, Zoological Science, 42, 60-67 (2025)
本研究では，線虫Pristionchus pacificusが光に対して順応すること示しました．またその過程にGタンパク質のβとγサブユニットが関わることを明らかにしました．
Nakayama, K., Hiraga, H., Manabe, A., Chihara, T., Okumura, M., “cGMP-dependent pathway and a GPCR kinase are required for photoresponse in the nematode Pristionchus pacificus“, PLoS Genetics, 20, e1011320 (2024)
線虫は眼のような特定の光受容器官を持たないにも関わらず、いくつかの種で光反応性が確認されています。特にモデル生物のCaenorhabditis elegansにおいて光受容機構が明らかになっていますが、それ以外の線虫種がどのように光を受容しているかは分かっていませんでした。本研究では、線虫Pristionchus pacificusにおいて光忌避行動に関わる遺伝子や神経を遺伝学的手法を駆使して明らかにしました。その一部はC. elegansと異なる経路を使用しており、線虫における光受容機構の多様性の一端を明らかにしました。
プレスリリースはこちら．JST news, Optronicsで紹介されました！表紙に採用されました！
Kamemura, K., Kozono, R., Tando, M., Okumura, M., Koga, D., Kusumi, S., Tamai, K., Okumura, A., Sekine, S., Kamiyama, D., Chihara, T., “Secretion of endoplasmic reticulum protein VAPB/ALS8 requires topological inversion”, Nature Communications, 15, 8777 (2024)
Muramoto, M., Hanawa, N., Okumura, M., Chihara, T., Miura, M., Shinoda, N. “Executioner caspase is proximal to Fasciclin 3 which facilitates non-lethal activation in Drosophila olfactory receptor neurons“, eLife (2024)
最終版が公開されました
紹介記事(東京大学薬学部): https://www.f.u-tokyo.ac.jp/topics.html?key=1750144810
Onodera, A., Zhang, A., Chihara, T., Sommer, R.J., Okumura, M., “Glutamate, GABA, and dense-core vesicle secretion regulate predatory feeding in the nematode Pristionchus pacificus”, bioRxiv
Ishita, Y., Onodera, A., Ekino, T., Chihara, T., Okumura, M., “Co-option of an astacin metalloprotease is associated with an evolutionarily novel feeding morphology in a predatory nematode”, Molecular Biology and Evolution, 40, msad266, (2023)
動物が多様な食性を獲得するためには、その食糧源に合わせた摂食器官を進化させる必要があります。本研究では、バクテリアを摂食するC. elegansと、線虫を食べる線虫P. pacificusを用いて、線虫の食性がどのように進化してきたのか、その機構の一端を解明しました。順遺伝学的スクリーニングやゲノム編集、遺伝子導入などの遺伝学的手法を駆使し、アスタシンメタロプロテアーゼというタンパク質分解酵素の一つがその発現場所を変えることで、P. pacificusとC. elegansで異なる摂食器官の形態形成に機能することを明らかにしました。本研究は、明治大学の浴野泰甫先生との共同研究です。
プレスリリースはこちら．
Ito, A., Matsuda N., Ukita Y., Okumura, M., Chihara, T., “Akaluc/AkaLumine bioluminescence system enables highly sensitive, non-invasive and temporal monitoring of gene expression in Drosophila” Communications Biology, 6, 1270, (2023)
Honda, D., Okumura, M., Chihara, T., “Crosstalk between the mTOR and Hippo pathways”, Development Growth and Differentiation, 65, 337-347, (2023)
Guo, R., Fujito, R., Nagasaki, A., Okumura, M., Chihara, T., Hamao, K., “Dynamin-2 regulates microtubule stability via an endocytosis- independent mechanism”. Cytoskeleton, 79, 94-104 (2022)
Ukita, Y., Okumura, M., Chihara, T., “Ubiquitin proteasome system in circadian rhythm and sleep homeostasis: Lessons from Drosophila”. Genes to Cells, 27, 381-391 (2022)
Kamemura, K., Moriya, H., Ukita, Y., Okumura, M., Miura, M., Chihara, T. “Endoplasmic reticulum proteins Meigo and Gp93 govern dendrite targeting by regulating Toll-6 localization“. Developmental Biology, 484, 30-39 (2022)
Takeuchi, K., Honda, D., Okumura, M., Miura, M., Chihara, T. “Systemic innate immune response induces death of olfactory receptor neurons in Drosophila“. Genes to Cells, 27, 113-123 (2022)
Hiraga, H., Ishita, Y., Chihara, T., Okumura, M. “Efficient visual screening of CRISPR/Cas9 genome editing in the nematode Pristionchus pacificus” Development Growth & Differentiation, 63, 488-500 (2021)
線虫Pristionchus pacificusにおけるゲノム編集技術のプロトコールを紹介しています．2種類のインジェクションマーカーを用いて効率的にゲノム編集個体のスクリーニングを行う方法です．表紙（左下）にも採用されました！2022年Young Investigator Paper Award (DGD奨励賞)を受賞しました。受賞理由はこちらから。
Kamemura, K., Chen, C., Okumura, M., Miura, M., Chihara, T. “Amyotrophic lateral sclerosis‐associated VAP33 is required for maintaining neuronal dendrite morphology and organelle distribution in Drosophila” Genes to Cells, 26, 230-239 (2021)
Ishita, Y., Chihara, T., Okumura, M., “Different combinations of serotonin receptors regulate predatory and bacterial feeding behaviors in the nematode Pristionchus pacificus“, G3:Genes, Genomes, Genetics, 11, jkab011 (2021)
線虫Pristionchus pacificusは他の線虫に対する捕食行動とバクテリア食性を示します．本研究ではゲノム編集技術を用いてセロトニン受容体の変異体を網羅的に作出し，セロトニンの下流でどのようなセロトニン受容体が機能し，2つの摂食行動を制御しているか明らかにしました．
Rödelsperger, C., Ebbing, A., Sharma, DR., Okumura, M., Sommer, RJ., Korswagen, HC. “Spatial transcriptomics of nematodes identifies sperm cells as a source of genomic novelty and rapid evolution” Molecular Biology and Evolution, 38, 229-243 (2021)
線虫Pristionchus pacificusではこれまで組織特異的な遺伝子発現解析がされていませんでした．本研究では，20 µm間隔で線虫の輪切り凍結切片を作製し，一つ一つの切片からRNAを増幅してRNAシーケンシングを行いました．これにより，モデル線虫であるC. elegansとの1:1オルソログであっても発現パターンには保存性が低いことや，精巣の領域で進化的に新しい遺伝子の発現が多いということを明らかにしました．本研究はドイツ・Max Planck研究所Rödelsperger博士およびオランダ・ユトレヒト研究所 Korswagen教授との共同研究です．Annabelさんが描いた絵が表紙に選ばれました．
Ono, T., Terada, F., Okumura, M., Chihara, T., Hamao, K. “Impairment of cytokinesis by cancer-associated DAPK3 mutations” Biochem Biophys Res Commun, 533, 1095-1101 (2020)
Nakayama, K., Ishita, Y., Chihara, T., Okumura, M. “Screening for CRISPR/Cas9-induced mutations using a co-injection marker in the nematode Pristionchus pacificus” Development Genes and Evolution, 230, 257–264 (2020)
線虫Pristionchus pacificusにおいてCRISPR/Cas9法を用いたゲノム編集を簡便に行うためのインジェクションマーカーを確立しました．
Ishita, Y., Chihara, T., Okumura, M. “Serotonergic modulation of feeding behavior in Caenorhabditis elegans and other related nematodes”
Neuroscience Research, 154, 9-19 (2020)
神経調節物質であるセロトニンは，多くの動物で摂食行動に関与していることが知られています．この総説では，線虫特に，C. elegansにおいてセロトニン神経回路がどのように摂食行動を制御しているか，最近の知見を紹介しています．
Okumura, M. Wilecki, M. and Sommer, R.J. “Serotonin Drives Predatory Feeding Behavior via Synchronous Feeding Rhythms in the Nematode Pristionchus pacificus” G3: Genes, Genomes, Genetics 7:3745-3755 (2017)
広島大学・研究成果ページ
線虫Pristionchus pacificusは他の線虫に対する捕食行動を示します．その際神経調節物質であるセロトニンが重要な役割を担うことをゲノム編集技術などを用いて示しました．
Okumura, M., and Chihara, T. “Function of pioneer neurons specified by the basic helix-loop-helix transcription factor atonal in neural development” Neural Regen Res11:1394-1395 (2016)
2016年発表した Genes to Cells 21:53-64 (2016) の内容をまとめた総説です。嗅覚神経回路の形成過程におけるプロニューラル遺伝子Atonalの機能を説明しています。
Okumura, M., Kato, T., Miura, M. and Chihara, T. “Hierarchical axon targeting of Drosophila olfactory receptor neurons specified by the proneural transcription factors Atonal and Amos” Genes Cells 21:53-64 (2016)
ショウジョウバエ嗅覚系の神経回路が作られる過程において，感覚神経に階層性があることを示しました．転写因子Atonalによって運命決定される感覚神経の軸索が先に触角葉へと伸長し，あとから伸長してくる，転写因子Amosによって運命決定される感覚神経の軸索投射に影響することを明らかにしました．
Lightfoot, JW., Wilecki, M., Okumura, M. and Sommer RJ. “Assaying Predatory Feeding Behaviors in Pristionchus and Other Nematodes” J Vis Exp, 4:doi: 10.3791/54404 (2016)
線虫Pristionchus pacificusの捕食行動を定量化するための方法を動画を用いて紹介している論文です．
Sakuma, C., Okumura, M., Umehara, T., Miura, M. and Chihara, T. “A STRIPAK component Strip regulates neuronal morphogenesis by affecting microtubule stability” Sci Rep 5:17769 (2015)
Okumura, M., Miura, M. and Chihara, T. “The roles of tubulin-folding cofactors in neuronal morphogenesis and disease”
Neural Regen Res, 10: 1388-1389 (2015)
Okumura, M., Sakuma, C., Miura, M. and Chihara, T. “Linking cell surface receptors to microtubules: Tubulin folding cofactor D mediates Dscam functions during neuronal morphogenesis” J Neurosci 35:1979-1990 (2015)