Des del 12 de gener de 2020 coneixem el genoma complet del virus SARS-CoV-2. És un genoma de RNA d'una sola cadena i conté uns 30000 nucleòtids. És molt semblant al d'altres coronavirus. Cada dia es diagnostiquen centenars de casos nous de Covid-19, però com saben els metges que estan davant d'aquesta malaltia i no d'una altra de semblant, com una grip, que puguin acabar causant pneumònies en persones especialment vulnerables? Existeixen proves per diagnosticar una infecció per SARS-CoV-2 basades en el genoma del virus. Es pot recollir material genètic de la mucosa respiratòria i buscar-hi indicis del genoma del virus com qui busca pistes a l'escena d'un crim.
Us proposem que feu el mateix que faria un metge davant d'unes quantes seqüències de nucleòtids sospitosos de pertànyer al patògen que causa una pneumònia en cinc pacients diferents. Mitjançant eines bioinformàtiques heu d'identificar quina és la causa de les pneumònies dels cinc pacients problema. Potser en algun hi detectem una infecció per SARS-CoV-2...
Genomes seqüenciats
Eines bioinformàtiques
Quin és l'agent patògen que causa les pneumònies dels cinc pacients? N'hi ha algun amb Covid-19?
Com ho fan en un laboratori per aconseguir les seqüències de nucleòtids sospitoses?