ศูนย์การเรียนรู้ระดับตำบลเกาะพะงัน เดิมใช้อาคารอำเภอหลังเก่าเป็นสถานที่พบกลุ่มนักศึกษา ต่อมาในปี พ.ศ. 2554 ได้รับงบประมาณการก่อสร้าง กศน. ตำบล ในวงเงินงบประมาณ 880,000 บาท และได้ก่อสร้างบนที่ดินราชพัสดุ กรมธนารักษ์ ตั้งอยู่เลขที่ 128/1 หมู่ 1 ตำบลเกาะพะงัน อำเภอเกาะพะงัน จังหวัดสุราษฎร์ธานี เป็น กศน. ตำบลที่มีพื้นที่เป็นเอกเทศเพื่อจัดการเรียนการสอน และเป็นที่ตั้งศูนย์ฝึกอาชีพชุมชนตำบลเกาะพะงันด้วย
กระทั่งวันที่ 18 มีนาคม พ.ศ. 2566 ราชกิจจานุเบกษาได้เผยแพร่ พระราชบัญญัติส่งเสริมการเรียนรู้ พ.ศ. 2566 โดยมีสาระสำคัญคือการยกเลิกพระราชบัญญัติส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัย พ.ศ. 2551 และยกฐานะ สำนักงานส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัย เป็น "กรมส่งเสริมการเรียนรู้" โดยให้มีผลบังคับใช้เมื่อพ้นไป 60 วันหรือตรงกับวันที่ 18 พฤษภาคม พ.ศ. 2566 และศูนย์การศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยตำบลเกาะพะงัน จึงได้เปลี่ยนชื่อเป็นศูนย์การเรียนรู้ระดับตำบลเกาะพะงัน สังกัดศูนย์ส่งเสริมการเรียนรู้ระดับอำเภอเกาะพะงัน สำนักงานส่งเสริมการเรียนรู้จังหวัดสุราษฎร์ธานี กรมส่งเสริมการเรียนรู้ กระทรวงศึกษาธิการ
ศูนย์การเรียนรู้ระดับตำบลเกาะพะงัน มีบทบาทหน้าที่ในการจัดการศึกษานอกโรงเรียนสายสามัญ ในหลักสูตรการศึกษาขั้นพื้นฐาน พ.ศ. 2551 จัดการเรียนการสอนผู้ไม่รู้หนังสือ เพื่อให้อ่านออกเขียนได้ การศึกษาในระดับประถมศึกษา ระดับมัธยมศึกษาตอนต้น และระดับมัธยมศึกษาตอนปลาย การศึกษาต่อเนื่อง หลักสูตรเพื่อการมีงานทำ การศึกษาเพื่อพัฒนาทักษะชีวิต การศึกษาเพื่อพัฒนาสังคมและชุมชน และการศึกษาตามอัธยาศัย โดยจัดให้มีบ้านหนังสืออัจฉริยะในชุมชน การจัดตั้ง ศกร.ตำบล มีวัตถุประสงค์เพื่อจัดการเรียนรู้ที่หลากหลายตามความต้องการของผู้เรียน เป็นแหล่งเรียนรู้ ตลอดชีวิตอย่างทั่วถึงและเท่าเทียมกันสำหรับผู้สนใจและประชาชนในชุมชน ปัจจุบัน นางสาวตรียาพร อำไพเมือง เป็นหัวหน้าศูนย์การเรียนรู้ระดับตำบลเกาะพะงัน