Presentation

1. "Effects of Reduction of a Plant-Type Ferredoxin [2Fe-2S] Active Center on Its Structure and Dynamics with Molecular Dynamics Simulations."

Takano, Yu; Nakayoshi, Tomoki; Onishi, Yusuke; Tanaka, Hideaki; Kurisu, Genji

International Congress on Pure & Applied Chemistry Bali (ICPAC Bali) 2023

Bali, Indonesia, September 15, 2023.

2. "Computational study of metal centers in proteins."

Saito, Toru; Suenaga, Shunya; Fujiwara, Tatsuya; Takano, Yu

10th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference

Kobe, Japan, November 29, 2022.

3. "Depolarizing effects in hydrogen bond energy in 310-helices revealed by quantum chemical analysis."

Takano, Yu; Kondo, Hiroko X.; Nakamura, Haruki

International Congress on Pure & Applied Chemistry Kota Kinabalu (ICPAC Kota Kinabalu) 2022

Kota Kinabalu, Malaysia, November 27, 2022.

4. "Hydrogen bond donors and acceptors are generally depolarized in α-helices as revealed by a negative fragmentation approach."

Takano, Yu; Kondo, Hiroko X.; Kusaka, Ayumi; Yamanaka, Shusuke; Nakamura, Haruki

International Congress on Pure & Applied Chemistry Yangon (ICPAC Yangon) 2019

Yangon, Myanmar, August 8, 2019.

5. "Statistical and quantum-chemical analysis of the effect of heme porphyrin distortion in heme proteins: .Differences between oxidoreductases and oxygen carrier proteins."

Takano, Yu; Kanematsu, Yusuke; Kondo, Hiroko X.; Imada, Yasuhiro

International Congress on Pure & Applied Chemistry Langkawi (ICPAC Langkawi) 2018

Langkawi, Malaysia, October 31, 2018.

6. "Theoretical analysis of the electronic asymmetry of the special pair cation radical in the photosynthetic reaction center."

Takano, Yu

6th JCS International Symposium on Theoretical Chemistry

Smolenice,  Slovakia,  October 14,  2015.

7. "Computational study of electronic structures of a characteristic [4Fe-4S] cluster, [Fe4S4(SCH3)3(CH3COO)], in dark-operative protochlorophyllide oxidoreductase."

Takano, Yu; Yonezawa, Yasushige; Fujita, Yuichi; Kurisu, Genji; Nakamura, Haruki

XVIth International Workshop on Quantum Systems in Chemistry and Physics

Ishikawa,  Japan,  September 15,  2011.

8. "Ligand coordination effects on the electronic structures of the models of hemocyanin."

Takano, Yu; Yamaguchi, Kizashi; Nakamura, Haruki

Diradicals and Multiradicals: Theory and Experiment

Namur,  Belgium,  July 28,  2009.

9. "Electronic structures of functional sites in membrane Proteins: H-pathway of cytochrome c oxidase and photosynthetic type-II reaction center."

Takano, Yu; Yamasaki, Hideki; Nakamura, Haruki

39th NIPS International Symposium & 7th OIB Symposium "Frontiers of Biological Imaging -Synergy of the Advanced Techniques-"

Okazaki,  Japan,  November 13,  2008.

10. "Conformational controls of tetrahedral intermediates in acylation step of ester hydrolysis by lipases and esterases."

Takano, Yu; Houk, K. N.

Houk65 Symposium Computational Chemistry: Orgo, Bio, Nano

California,  USA,  June 29,  2008.

11. "Molecular orbital study of the proton transfer through a peptide bond -A theoretical approach to a novel pathway of proton translocation of cytochrome c oxidase-."

Takano, Yu; Nakamura, Haruki

ICCMSE2007 (International Conference of Computational Methods in Sciences and Engineering)

Corfu,  Greece,  September 29,  2007.

12. "Molecular orital approach to a novel pathway of proton translocation of cytochrome c oxidase."

Takano, Yu; Nakamura, Haruki

Material-oriented Quantum Chemistry

Osaka, Japan,  May 29,  2006.

1. "分子シミュレーションを用いた植物型フェレドキシンの還元による構造変化の解析"

鷹野優

第31回「高速分子動画」オンラインセミナー

オンライン、 2023年6月20日.

2. "Computational study of the structural–function relationship of heme proteins"

鷹野優

第59回日本生物物理学会年会シンポジウム「Recent progress in biometal sciences: synergy between theory and experiments」

オンライン、 2021年11月25日.

3. "計算科学によるヘム蛋白質活性中心の分子構造-電子状態-機能相関解析"

鷹野優

CBI学会2021大会フォーカストセッション「金属タンパク質解析における構造生物学と量子化学計算の融合」

オンライン、 2021年10月27日.

4. "計算科学による金属蛋白質活性中心の電子構造制御に関する研究－ヘムの構造歪みに関する構造機能相関－"

鷹野優

スーパーコンピュータワークショップ2018「 理論・計算科学の挑戦：量子化学とシミュレーションからの展望 」

自然科学研究機構　岡崎コンファレンスセンター、 2019年1月16日.

5. "Statistical and quantum-chemical analysis of the effect of heme porphyrin distortion in heme protein"

鷹野優

第56回日本生物物理学会年会シンポジウム「Challenges and novel approaches to investigate the structures and dynamics of the 3D active sites in biomolecular systems for understanding the biochemical functions」

岡山大学津島キャンパス、 2018年9月15日.

6. "計算科学による金属蛋白質活性中心の電子構造制御に関する研究－ヘムの構造歪みに関する構造機能相関を例として－"

鷹野優

第31回生物無機化学夏季セミナー

ホテル竹島、 2018年9月14日.

7. "コンピュータを使って金属タンパク質の活性サイトを観察・分類し、しくみを理解する"

鷹野優

北見工業大学バイオ情報学セミナー

北見工業大学、 2018年7月12日.

8. "コンピュータシミュレーションでタンパク質のはたらきを理解する"

鷹野優

日本薬学会東海支部特別講演会

名城大学八事キャンパス、 2017年12月6日.

9. "コンピュータを使って金属タンパク質の活性サイトを観察・分類し、しくみを理解する"

鷹野優

大阪大学大学院理学研究科化学専攻・高分子学専攻 平成29年度第2回化学・高分子コロキウム講演会

大阪大学豊中キャンパス、 2017年11月25日.

10. "Elucidation of structure-function relationship of biological active sites by molecular simulation"

鷹野優・兼松佑典・今田康博

第54回日本生物物理学会年会シンポジウム「時空間精密構造解析による生体分子活性サイトの機能解明」

つくば国際会議場、 2016年11月25日.

11. "計算科学による金属タンパク質の活性中心の電子構造制御に関する研究"

鷹野優

日本物理学会2016年秋季大会

金沢大学角間キャンパス、 2016年9月14日.

12. "タンパク質の二次構造に働く相互作用の理論解析"

鷹野優

大阪大学蛋白質研究所セミナー「構造を基盤とする蛋白質科学の未解決問題」

東京大学先端科学技術研究センターENEOSホール、 2016年3月1日.

13. "Theoretical study of the relationship between heme distortion and redox potential"

Yu Takano and Yasuhiro Imada

第53回日本生物物理学会年会シンポジウム「生体分子活性サイトの新しい３Ｄ構造決定法と機能解析」

金沢大学角間キャンパス、 2015年9月13日.

14. "生体活性サイトの構造・機能相関の解明とデザインに向けた分子技術の開発"

鷹野優

計算科学勉強会

大阪大学中之島センター、 2015年2月21日.

15. "タンパク質の二次構造に働く相互作用の理論解析"

鷹野優

第52回量子物理化学セミナー

横浜市立大学、 2015年2月6日.

16. "密度汎関数法による遷移金属蛋白質活性中心の構造・反応探索における問題ーチロシナーゼ活性中心モデルを例としてー"

鷹野優

シンポジウム「化学反応経路探索のニューフロンティア2014」

広島大学学士会館、 2014年9月20日.

17. "蛋白質の二次構造形成に関わる相互作用に関する理論的研究"

鷹野優

第14回蛋白質科学会年会

ワークピア横浜／横浜産貿ホール マリネリア、 2014年6月26日.

18. "蛋白質中における金属補因子の電子構造制御ーQM法、QM/MM法による解析ー"

鷹野優・中村春木

近畿化学協会コンピュータ化学部会公開講演会＆見学会「量子論と古典論が綴るシミュレーションの世界」

理化学研究所 計算科学研究機構、 2014年5月9日.

19. "蛋白質中における金属補欠分子の電子構造制御に関する理論的研究"

鷹野優

計算生命科学WG第3回講演会

筑波大学計算科学研究センター、 2014年3月17日.

20. "金属蛋白質中の補欠分子の電子構造の計算化学的研究"

鷹野優

蛋白質研究所セミナー「結晶構造を併用したハイブリッド構造研究の最前線」

大阪大学蛋白質研究所、 2014年2月8日.

21. "金属タンパク質中の補欠分子の分子構造ー電子構造ー機能相関 "

鷹野優

第6回協定講座シンポジウム「計算生物学と材料科学の融合II」

神戸大学統合研究拠点、 2013年11月20日.

22. "電子伝達部位CuAの分子構造−電子構造相関 ー理論計算による機能性遷移金属蛋白質の演繹的デザインを目指してー "

鷹野優

第42回三重大学CUTEセミナー

三重大学極限ナノエレクトロニクスセンター、 2013年1月15日.

23. "Platypus-QM/MMの開発と応用 "

鷹野優

ISLiMソフトウェア研究開発報告会

東京大学武田ホール、 2013年1月10日.

24. "分子環境を記述するためのPCM（分極連続体モデル）の使い方と金属蛋白質活性中心への適用"

鷹野優

第13回大つくば物理化学セミナー

城西大学鋸南セミナーハウス、 2012年12月7日.

25. "光非依存型プロトクロロフィリド還元酵素中の[4Fe–4S]クラスターの電子構造の理論的研究."

鷹野優・米澤康滋・藤田祐一・栗栖源嗣・中村春木

第11回蛋白質科学会

ホテル阪急エキスポパーク、 2011年6月8日.

26. "Electronic structures of the novel [4Fe–4S] cluster in dark-operative protochlorophyllide oxidoreductase."

鷹野優・米澤康滋・藤田祐一・栗栖源嗣・中村春木

第48回日本生物物理学会

東北大学川内キャンパス、 2010年9月20日.

27. "A density functional approach to a novel pathway of proton translocation of cytochrome c oxidase."

鷹野優

平成20年度蛋白質研究所リトリート

神戸セミナーハウス、 2008年12月17日.

28. "酸素運搬タンパク質ヘムエリスリンの活性中心の電子構造および化学結合様式に関する理論的研究."

鷹野優・山口兆・中村春木

第102回触媒討論会

名古屋大学東山キャンパス、 2008年9月25日.

29. "金属タンパク質の活性中心の電子構造−これまでやったことと、これからやりたいこと−."

鷹野優

若手研究会「理論分子科学のフロンティアを探る」

分子科学研究所、 2008年1月16日.

30. "分子軌道法によるチトクロムc酸化酵素の新しいプロトン輸送経路への理論的アプローチ-heme aの酸化還元における電子構造とペプチドを介したプロトン移動との関係-."

鷹野優

第39回つくば計算物質生命科学コロキウム

筑波大学計算科学研究センター、 2007年11月27日.

31. "エステル加水分解酵素の反応機構に関する理論的研究—酵素反応と反応中間体のコンフォーメーションとの相互関係—."

鷹野優

ITBL総合シンポジウム

大阪科学技術センター、 2006年2月4日.

32. "密度汎関数法の生体系における遷移金属クラスターへの適用."

鷹野優・曽田智久・磯部寛・山口兆

「ポストゲノム時代のタンパク質大規模計算の現状と動向」講演会 −タンパク質の全電子計算プログラム Protein DFの公開に向けて−

株式会社富士総合研究所計算科学技術センター,  2001年9月.

33. "分子磁性体のab initio計算."

鷹野優

スーパーコンピュータワークショップ2001 「分子科学と大規模計算」

分子科学研究所,  2001年3月22日.