โรงเรียนวัดท้องคุ้ง เปิดทำการสอนวันแรก เมื่อวันที่ ๙ ตุลาคม ๒๔๗๖ โดยอาศัยศาลาวัดท้องคุ้งเป็นที่เรียน ขุนบริบาลสุขประชา นายอำเภอพระประแดงเป็นประธานในการเปิดเรียน นายสาย รัศมิทัต ศึกษาธิการอำเภอพระประแดง ได้ทำการสอนเป็นปฐมฤกษ์ มีครู 2 คน นายแดง สุภจิต เป็นครูใหญ่ มีนักเรียน 45 คน
ต่อมา พ.ศ. ๒๔๘๑ พระศรีสมุทรคุณ เจ้าอาวาสวัดท้องคุ้ง พร้อมด้วย นางกลับ มังคะลี ได้ให้การอุปการะร่วมกับทางราชการจัดสร้างอาคารแบบ ป. ๒ ชนิดถาวร ๔ ห้องเรียน ค่าก่อสร้าง 2,570 บาท ให้ชื่อว่า “โรงเรียนท้องคุ้งมังคะลีรังสรรค์" และย้ายนักเรียนมาทำการสอนที่อาคารเรียนหลังใหม่ เมื่อวันที่ ๑ พฤษภาคม พ.ศ. ๒๔๘๑
ต่อมา พ.ศ. ๒๕๑๓ นักเรียนเพิ่มจำนวนมากขึ้น สถานที่เดิมไม่พ่อเรียน นายดำรง จ่างตระกูล ได้บริจาคที่ดินจำนวน ๑ ไร่ ๓ งาน ๘๘ ตารางวา ให้กับโรงเรียน นายทองต่อ กล้วยไม้ ณ อยุธยา นายอำเภอพระประแดง ได้ดำเนินการก่อสร้างอาคารเรียนแบบ ๐๑๗ ขนาด ๔ ห้องเรียน มูลค่า 250,000 บาท ซึ่งได้รับงบประมาณจากทางราชการ และได้เปลี่ยนชื่อโรงเรียนใหม่เป็น “โรงเรียนท้องคุ้ง (จ่างตระกูล)” และได้ย้ายนักเรียนมาเรียนเมื่อวันที่ 26 ตุลาคม พ.ศ. 2514 มีครู 5 คน นักเรียน 161 คน
พ.ศ. 2515 ขออนุญาตเปิดสอนชั้นประถมปลาย ได้รับความอนุเคราะห์จากนายดำรง จ่างตระกูล ต่อเติมอาคารเรียนอีก 2 ห้องเรียน รวมเป็น 6 ห้องเรียน นักเรียน 200 คน ครู 6 คน
พ.ศ. 2517 วันที่ 16 กรกฎาคม นายเปรื่อง คงมณี ย้ายมาดำรงตำแหน่ง ครูใหญ่ และนายดำรง จ่างตระกุล ได้อนุเคราะห์เงินส่วนตัว สร้างอาคารเรียน แบบ 017 อีก 1 หลัง มูลค่า 350,000 บาท รวมมีอาคารเรียน 2 หลัง 13 ห้องเรียน นักเรียน 413 คน ครู 14 คน
พ.ศ. 2521 นายเปรื่องคงมณี เกษียณอายุราชการ ทางราชการได้ส่งนางประชุม โพธิ์เมือง มาดำรงตำแหน่งครูใหญ่แทน ตั้งแต่วันที่ 1 พฤษภาคม 2522
พ.ศ. 2526 ได้รับการสนับสนุนงบประมาณจากนายสนิท กุลเจริญ ต่อเติมอาคารชั้นล่างให้เป็นฝากั้นปูนถาวร จำนวน 3 ห้องเรียน
พ.ศ. 2527 ได้รับงบประมาณก่อสร้างจาก สปช. ให้ก่อสร้างอาคารอเนกประสงค์ 1 หลัง
พ.ศ. 2530 ได้รับงบประมาณก่อสร้างส้วม จำนวน 2 ที่นั่ง
พ.ศ. 2531 นางประชุม โพธิ์เมือง ได้ย้ายไปดำรงตำแหน่งที่โรงเรียนวัดกลาง ทางราชการได้ส่ง นายสมยา ทองก้อน มาดำรงตำแหน่งแทนในวันที่ 1 พฤศจิกายน 2531 มีครู 20 คน นักเรียน 321 คน
ต่อมาเมื่อวันที่ ๑๖ มิถุนายน ๒๕๓๓ เวลา 10.50 น. โรงเรียนประสบอัคคีภัย เสียหาย ดังนี้
- อาคารเรียนแบบ 017 จำนวน 2 หลัง จำนวน 20 ห้องเรียน
- บ้านพักครูแบบกรมสามัญ จำนวน 4 หลัง
- อาคารโรงฝึกงานแบบ 312 จำนวน 1 หลัง
- ส้วมแบบองค์การ จำนวน 2 หลัง 8 ที่นั่ง
- เรือนเพาะชำ จำนวน 1 หลัง
- ถังน้ำซีเมนต์ แบบ ฝ. 22 จำนวน 2 ถัง
- ครุภัณฑ์ และอุปกรณ์อื่น ๆ เสียหายทั้งสิ้น 1,221,150 บาท
วันที่ 18 มิถุนายน 2533 จึงย้ายไปเรียนที่ศาลาวัดท้องคุ้งและสร้างอาคารเรียนชั่วคราว จำนวน 13 ห้องเรียน ซึ่งได้รับงบประมาณก่อสร้างอาคารเรียนแบบ สปช. ๒/๒๘ จำนวน ๑๕ ห้องเรียน งบประมาณ 4,260,000 บาท บ้านพักครูเรือนแถวแบบ สปช. 303/28 จำนวน 4 หน่วย งบประมาณ 864,000 บาท และส้วมแบบ 602/26 จำนวน 10 ที่นั่ง งบประมาณ 200,000 บาท โดยใช้ที่ดินของวัดจำนวน ๑ ไร่ และรับบริจาคจากนางสาวหงส์ เอื้อสุนทรพานิช และนายไสว มังคะลี คิดเป็นมูลค่า 3,600,000 บาท ย้ายมาเรียนในโรงเรียนใหม่ ในวันที่ 1 พฤษภาคม 2534 เปิดสอนตั้งแต่อนุบาล ถึงประถมศึกษาปีที่ 6 มีนักเรียน 406 คน จัดเป็น 14 ห้องเรียน มีครู 18 คน และเปลี่ยนชื่อโรงเรียนใหม่เป็น “โรงเรียนวัดท้องคุ้ง”
ปีงบประมาณ 2538 ได้รับงบประมาณก่อสร้างอาคารอเนกประสงค์ สปช. 205/26 ราคา 1,200,00 บาท และอาคารห้องสมุดจากงบพัฒนาจังหวัดของ ส.ส. วัฒนา อัศวเหม ราคา 405,000 บาท
ปีการศึกษา 2542 นายสมยา ทองก้อน ย้ายไปดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดแพรกษา สำนักงานการประถมศึกษาอำเภอเมือง จังหวัดสมุทรปราการ
ตั้งแต่วันที่ 1 กรกฎาคม 2542 มีนางสาวประภา พิเชษฐกร ผู้ช่วยผู้อำนวยการโรงเรียนบ้าน บางจาก เป็นผู้รักษาราชการแทน ระหว่างรอผู้อำนวยการโรงเรียนคนใหม่
วันที่ 15 ตุลาคม 2542 สำนักงานคณะกรรมการการประถมศึกษาแห่งชาติ ส่ง นางธัชชนก เถาบัว มาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียน โดยเดินทางมารับตำแหน่งในวันที่ 1 พฤศจิกายน 2542
พ.ศ. 2543 ได้รับการสนับสนุนจากอง๕การบริหารส่วนจังหวัดสมุทรปราการ สร้างหลังคาสนามปูน เพื่อกันแดด มูลค่า 350,000 บาท และได้รับการสนับสนุนจากกรรมการสถานศึกษาและชุมชน ผู้ปกครองนักเรียน ร่วมจัดหาทุนเพื่อปูกระเบื้องอาคารอเนกประสงค์ จัดสร้างม่านเวที รวมทั้งจัดหาคอมพิวเตอร์ เพื่อการเรียนการสอน จำนวน 2 เครื่อง มูลค่า 170,000 บาท
ปีการศึกษา 2544 คณะครูได้ร่วมแรงร่วมใจ ในการพัฒนาโรงเรียน เพื่อสนองนโยบายของสำนักงานการประถมศึกษาอำเภอพระประแดง “ ปฏิรูปการเรียนรู้ มุ่งสู่มาตรฐาน ประสานความร่วมมือ”
ต่อมา พ.ศ. ๒๕๔๘ นางธัชชนก เถาบัว ร่วมกับชุมชนได้ระดมทุนซื้อที่ดินเพิ่มให้โรงเรียนอีกจำนวน ๑๕๑ ตารางวา จากนางสาวหงส์ เอื้อสุนทรพานิช เป็นเงิน 1,725,000 บาท และได้รับบริจาค จากนางสาวหงส์ เอื้อสุนทรพานิช อีกจำนวน ๑๐๐ ตารางวา จึงทำให้ปัจจุบัน โรงเรียนวัดท้องคุ้ง มีที่ดิน ๒ แปลง แปลงที่ ๑ ที่ตั้งอาคารเรียนหลังเก่า และบ้านพักครู ขึ้นทะเบียนเป็นที่ราชพัสดุ มีพื้นที่ ๑ ไร่ ๓ งาน ๘0 ตารางวา แปลงที่ ๒ เป็นที่ตั้งโรงเรียนปัจจุบันมีเนื้อที่ ๒ ไร่ ๒ งาน ๕๑ ตารางวา ตั้งอยู่เลขที่ ๓ หมู่ ๒ ตำบลบางหญ้าแพรก อำเภอพระประแดง จังหวัดสมุทรปราการ ๑๐๑๓๐
วันที่ 22 พฤษภาคม 2551 นายศุภชัย ประศิริ ได้ย้ายมาจากโรงเรียนโพธิ์ทองวิทยา อำเภอ ปักธงชัย มาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดท้องคุ้ง ย้ายสับเปลี่ยนกับนางธัชชนก เถาบัว
ปี พ.ศ. 2552 ช่วงเดือนเมษายน ชมรมดรากอนเวย์ สมุทรปราการ ได้สร้างอาคารเพื่อใช้เป็นที่นั่งรับประทานอาหารกลางวันสำหรับนักเรียน ใช้งบประมาณ 100,000 บาท ได้เทพื้นคอนกรีต และตั้งเสา 10 ต้น
วันที่ 7 มีนาคม 2552 โรงเรียนได้ทอดผ้าป่าเพื่อการศึกษา ได้เงิน 130,000 บาท นำไปก่อสร้างส้วม 4 ที่นั่ง
ปี 2552 ช่วงเดือน กรกฎาคม-สิงหาคม บริษัทกระดาษสหไทย จำกัด ได้ซ่อมแซม ปรับปรุงส้วม สปช.602/26 จำนวน 10 ที่นั่ง งบประมาณ 100,000 บาท และช่วงเดือน กันยายน บริษัทยางสยาม ได้ทำเรือนเพาะชำให้ 1 หลัง งบประมาณ 100,000 บาท
วันศุกร์ที่ 18 พฤษภาคม 2555 สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสมุทรปราการ เขต 1 มีคำสั่งแต่งตั้งผู้อำนวยการโรงเรียน โดยให้นายศุภชัย ประศิริ ไปดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดบางหัวเสือ และนายตรี ศตสังวัตสร์ ผู้อำนวยการโรงเรียนวัดคู่สร้าง อำเภอพระสมุทรเจดีย์ ได้รับคำสั่งแต่งตั้งดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดท้องคุ้ง และได้เดินทางมารับตำแหน่งเริ่มปฏิบัติหน้าที่ตั้งแต่วันที่ 25 พฤษภาคม 2555
วันที่ 10 ตุลาคม 2559 นายตรี ศตสังวัตสร์ ได้ย้ายไปดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนบ้านบางจาก อำเภอพระประแดง ตามคำสั่ง สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสมุทรปราการ เขต 1 ที่ 423/2559 ลงวันที่ 28 กันยายน 2559 โดยมอบหมายให้นางสาวสนอง พึ่งสาย ตำแหน่งครู วิทยฐานะครูชำนาญการพิเศษ รักษาราชการแทน
ปีงบประมาณ 2559 ได้รับงบประมาณจากเทศบาลเมืองปู่เจ้าสมิงพราย ปรับปรุงซ่อมแซมอาคารอเนกประสงค์หอประชุมโรงเรียน เป็นเงิน 1,030,000 บาท
ปีงบประมาณ 2559 ได้รับงบประมาณจากสำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน ก่อสร้างบ้านพักครู แบบ 205/26 จำนวน 1 หลัง เป็นเงิน 722,400 บาท ณ ที่ราชพัสดุซึ่งเป็นพื้นที่ตั้งเดิมของโรงเรียนที่เกิดเหตุอัคคีภัย
วันที่ 22 ธันวาคม 2559 สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสมุทรปราการ เขต 1 มีคำสั่งที่ 580/2559 ลงวันที่ 21 ธันวาคม 2559 มีคำสั่งเปลี่ยนตำแหน่งข้าราชการครูและบุคลากรทางการศึกษา กรณี นายธีรศักดิ์ นรดี รองผู้อำนวยการโรงเรียนเตรียมอุดมศึกษาน้อมเกล้า สมุทรปราการ ให้ได้รับการแต่งตั้งเป็นผู้อำนวยการโรงเรียนวัดท้องคุ้ง โดยเดินทางมารับตำแหน่งและเริ่มปฏิบัติหน้าที่ตั้งแต่วันที่ 26 ธันวาคม 2559 จนถึงปัจจุบัน