1. 台灣南仁山森林動態樣區之研究: 包含森林結構，森林動態與全球變遷關係，天然森林生物量，森林碳循環等。
關於南仁山的英文介紹
2. 蜂蜜花粉鑑別與生態: 包含花粉鑑定、NGS分析、蜜蜂食性分析等。
3. 稀有物種族群生態研究: 包含台灣一葉蘭以及槲櫟的族群監測與保育策略擬定。
4. 合歡山高海拔生態系研究。
5. 竹林調查監測與固碳能力研究。
6. 阿里山人文生態研究網(LTSER)下森林植物動態部分