Biokemi

Blue ball machine:

http://blueballfixed.ytmnd.com/

Kort sammanfattning av den biokemi som vi ska titta på:

Metabolism betyder ämnesomsättning. Den delas upp i två delar, anabolism, som betyder uppbyggnad

(jmf. anabola steroider som ju stimulerar tillväxt) och katabolism, som betyder nedbrytning.

Vi ska nu lära oss översiktligt om följande katabola reaktionsvägar:

Glykolysen

Aerob pyruvaraktivering/Anaerob mjölksyrabildning/Anaerob etanoljäsning (som utförs av jästsvampar)

Citronsyracykeln

Beta-oxidationen (fettnedbrytningen)

Andningskedjan.

Vår kost innehåller kolhydrater, fett och proteiner som alla kan ge oss energi. Vi tittar nu på stärkelse:

Stärkelse från maten spjälkas till glukos som cellerna tar upp från blodet.

I cellens cytoplasma finns ett tiotal enzymer som i ett tiotal steg bryter ner en glukosmolekyl till två pyruvatmolekyler.

Detta enzymsystem kallas tillsammans för glykolys.

I vissa av nedbrytningsstegen sker en oxidation av substratet. De elektroner som då avges

tas upp av en bärarmolekyl, som då reduceras. Bärarmolekylen transporterar sen elektronerna

till det sista steget i katabolismen, andningskedjan. Se de två första molekylerna bland OH:na om bärarmolekyler nedan.

I denna OH finns även ATP/ADP som är en energibärare. Energi frigörs då en fosfatgrupp spjälkas av.

Det går åt motsvarande energi då man vill 'ladda upp' en ADP till ATP, ca 31 kJ/mol.

Fortsättning följer...

Antonio:s superlänk till metabolismen på youtube.

OverHeads & läsanvisningar i boken:

Överblick över katabolismen: Den första OH:n är min lilla allra första som är så förenklad att den är fel.

Den andra visar schematiskt var någonstans i cellen de olika cyklerna (eller biochemical pathways) sker.

Länk till OH

Sidor: 264-övre 2/3 av 265

Allting regleras av enzymer

Länk till Flashanimering

Sidor: Undre 1/3 av 265-266

De olika bärarmolekylerna: OH:s på de olika molekyler som bär elektroner, protoner, energi samt

acetylgrupper/C2-föreningar inom cellen. Dessa är i NAD+/NADH, FAD/FADH2, ATP/ADP/AMP samt CoA/Coenzym A.

Länk till OH

Sidor: 269-270, 272-273

Glykolysen

Glenn:s glycolysrap

Sidor i boken: 274-275

Från pyruvat till och med citronsyracykeln: Det tre olika sätt som pyruvat kan behandlas samt fortsättningen efter det första sättet till citronsyracykeln:

Länk till OH

Sidor i boken: 276-277

Betaoxidationen:

Denna cykel kallas även för fettnedbrytning. Kroppens i särklass största lagrade energiförråd utgörs av fett. Dels finns det

ett långtidslager i underhuden och kring tarmar och inre organ (visceralt fett). Det primära fettdepåer som används under

längre ansträngningar utgörs istället av små fettdroppar som lagras inne i de arbetande muskelcellerna.

Läs även om kroppens olika energilager i form av ATP, glukos, glykogen & fett på sidorna 282-283.

Missa inte heller denna låt om betaoxidationen

Länk till OH

Sidor i boken: 279

(Rima hälsar att ni ska läsa detta extra noga)

Cellandningen / andningskedjan / elektrontransportkedjan / oxidativ fosforylering:

Sidorna 6-8 i denna OH

Sidor i boken: 280-282 (Ej transaminering)

ATP syntetas - Det sista proteinkomplexet i andningskedjan - Kanske världens mest komplexa proteinkomplex???

+

Några gifter som direkt eller indirekt slår ut andningskedjan:

Länk till OH

Youtubeklipp om ATP syntas

Youtubeklipp över hela andningskedjan

Länk till Biblisk skapelsetro, en site vars upphovsmakare tror att livet har uppstått genom en övermänsklig och Intelligent Design, ID.

Här används ATP syntas som ett exempel på att att en komplex molekyl inte kan uppstå genom evolution, och det får man tro om man vill.

Det finns dock inga som helst positiva bevis för detta påhitt, ID. Tvärtom kan vetenskapen på ett hyfsat trovärdigt sätt förklara mycket - men

långt ifrån allt - till livets uppkomst. Jag vill ändå länka till denna sida då den har en väldigt fin illustration över denna fantastiska

molekyl, ATP syntas. Scrolla ned en bit så ser du den. !OBS! För att vara övertydlig - Hela denna site är skapad av kreationister, som företräder en extrem religiös inriktning. Ur ett strikt vetenskapligt perspektiv är budskapet alltså humbug & hittepå. !OBS!

Verkningsgraden från glukos till ATP I: Verkningsgraden definieras som mängden nyttiggjord energi

dividerat med totalt tillförd energi. En OH där vi summerar ihop alla ATP (GTP), NADH och FADH2 som

omsätts från en mol glukos som bryts ner via glykolysen, pyruvat, Acetyl-koenzym A, citronsyracykeln

och slutligen andningskedjan.

Länk till OH

Verkningsgraden från glukos till ATP II: Verkningsgraden definieras som mängden nyttiggjord energi

dividerat med totalt tillförd energi. En OH över den teoretiska verkningsgraden och en över den verkliga

då man tagit hänsyn till transportförluster mellan organellerna samt att koncentrationerna av olika ämnen inte är

standardiserade 1 molar inne i cellen och dess organeller.

Länk till OH