авторские on-line курсы

Компьютерные технологии в биологии (Stepik.org)

Цель освоения курса – получение практических навыков использования современных компьютерных технологий и информационных достижений, применительно к обработке, передаче и хранению биологических данных.

Данный курс полезен для биологов, а также прочим исследователям, которые прямо или косвенно занимаются живыми объектами (экологи, географы, палеонтологи, прикладные математики, натуралисты). Если вы стремитесь повысить методологический уровень ваших курсовых и дипломных работ, а также обогатить проектную деятельность в школе, то этот курс для вас. Полученные навыки по итогу курса могут быть использованы для подготовки научного проекта, дипломной работы, диссертационного исследовани, научной статьи и заявки на грант.

Фундаментом курса является биосферно-организменный уровень организации живого на планете Земля (животные, растения, грибы, микроорганизмы и пр., а также системы их взаимоотношений).

При работе с биологическими данными о живых организмах в курсе рассмотрены практические инструменты из сферы:

• информатики биоразнообразия (стандарты и протоколы хранения и обработки объективных данных о пространственном распространении живых организмов);

• анализа ДНК и молекулярно-генетических баз данных живых организмов;

• геоинформационных систем (ГИС) и географического зонирования;

• филогении и реконструкции таксономических связей живых организмов (филогенетическое дерево);

• модульного эволюционного анализа;

• подходы к ведению цифровых депозитариев и оцифровки биологических коллекций;

• моделирование прогнозного местообитания живого объекта (построение экологических ниш);

• подготовка презентационных материалов.

По окончанию курса вы получите специальные практические навыки работы с бесплатными пакетами программ (DIVA-GIS, Mesquit, MEGA, MaxEnt), открытыми глобальными ресурсами и спецификациями (GBIF, Darwin Core, iNaturalist, GeoJSON), специализированными ресурсами и базами знаний (электронные библиотеки, базы цитирования и пр.) для эффективной работы ученого-биолога, занятого исследованием живых объектов на планете Земля.

Компьютерные технологии в биологии и экологии (базовый курс)

Аннотация: курс способствует развитию у магистрантов практических навыковиспользования различных современных информационных технологий применительно к биологическим данным при решении профессиональных задач. Данный курс познакомит вас с основными современными тенденциями использования компьютерных технологий в научно-исследовательской и образовательной деятельности в области биологии и экологии. Вы получите навыки работы с пакетами программ из области биоинформатики, прикладных IT-решений и глобальными ресурсами Сети Интернет для эффективной работы биолога-исследователя.

Образовательный продукт поддержан грантовым конкурсом Благотворительного фонда Владимира Потанина для преподавателей магистратуры 2019/2020 у.г.

Единый образовательный портал Алтайского государственного университета (платформа Moodle):

Информатика и современные информационные технологии в биологии

Аннотация: в курсе подробно рассматриваются основные направления применения компьютерных информационных технологий в научно- исследовательской и образовательной деятельности в области биологии и экологии; компьютерные технологии работы с графической информацией; фотодокументирование в биологических и экологических исследованиях; использование информационно-коммуникационных технологий в биологическом знании; функциональных возможностях сети Интернет в работе биолога-исследователя; использование прикладных программ при работе с текстовой информацией и электронными таблицами; инструментарием для подготовки эффективной презентации; освоение навыков из начального раздела биоинформатики.

Математические методы в биологии и экологии

Аннотация: вне зависимости от вашей специализации (ботаника, зоология, биомедицина, биохимия и др.), использование данного курса для вас будет актуально. Особенно полезен данный инструментарий при подготовке курсовых работ и итоговой ВКР по специальности "Биология". Практическая составляющая курса реализована на базе "Пакет анализа" для MO Excel. Краткое содержание курса: история формирования математических методов в биологическом знании; введение в биометрию; работа со статистической совокупностью (одна выборка) - описательная статистика, t-критерий Стьюдента; сравнение двух и более выборок - двухвыборочный t-критерий Стьюдента, хи-квадрат (критерий Пирсона), дисперсионный анализ; корреляционно-регрессионный анализ (причинно-следственная связь; функциональная зависимость и корреляция; разновидности корреляционных связей; коэффициент корреляции по Пирсону; коэффициент корреляции по Спирмену; множественная и частная корреляцилинейная регрессия; коэффициент регрессии; разновидности регрессии (криволинейная, полиномиальная, множественная); связь между коэффициентом регрессии и корреляции).

Дополнительные материалы из курсов для прямого скачивания.