Research

연구주제 Research Projects

• 고자장, 다차원 NMR 분광학을 이용한 단백질 구조 및 동역학 연구

• 단백질 구조 및 동역학적 특성으로부터  생체분자의 기작을 설명하고 이해함

• 단백질 – ligand 상호작용에 대한 연구를 통해 생체 내 중요 이벤트에 대한 이해 증진

• 단백질 - ligand 상호작용을 바이오마커 검출에 응용

1. G-quadruplex helicase 의 구조 및  G4 DNA 인식 기작 연구 

: G-quadruplex (G4) 는 oncogene promoter, telomere 등 Guanine rich DNA 서열에서 생기는 non-canonical DNA structure 임

: DNA 복제, 전사 등을 위해 G-quadruplex 는 helicase 효소에 의해 resolve 됨

: RecQ helicase 중 Bloom syndrome protein (BLM) 은 G4 에 특이적으로 결합하며 G4 를 푸는 효소임

: BLM 의 RecQ C-terminal  domain (RQC) 는 BLM 의 주요 DNA 결합 모듈임

                - BLM RQC 도메인의 액체상 3차원 구조 규명 (Park, C.-J. et al., J. Biomol. NMR. (2014))

                - BLM RQC 도메인과 G4 DNA 와의 상호작용 연구 (Lee, S. et al., J. Mol. Biol. (2019), Lee, S. et al., ACS Omega (2020))

 2.  DNA metabolism 관여 단백질 간 상호작용 규명 연구 (RPA + various proteins) 

 : DNA damage response 시 Replication Protein A (RPA) 는 여러 파트너와 상호작용함

: RPA70 N-terminal domain (RPA70N) 은 단백질-단백질 상호작용에 활용되는 도메인임

: 암세포의 화학치료시 DNA 손상에 대응하는 DNA helicase 의 활성이 올라가며 RPA 와의 상호작용은 DNA helicase 의 활성을 더욱 높임

                - BLM N-terminal 과 RPA70N 과의 상호작용 규명 (Kang, D. et al., FEBS Letters, (2018))

                - WRN N-terminal, FANCJ C-terminal 과 RPA70N 과의 상호작용 규명 (Yeom, G. et  al., Sci. Rep. (2019))

                - phosphomimetic RPA32 N-terminal 과 RPA70N 과의 상호작용 규명 (Lee, S. et al., J. Biol. Chem. (2020))                  

 3. 노화세포 특이적 단백질-단백질 상호작용 규명

:  Senescent cell 은 세포 주기를 멈춘 상태로 SASP (Senescent Associated Secretory Phenotype) 을 분비하여 주변 세포까지 노화를 일으킴

: Senescent cell 에서는 FOXO4 단백질이 과발현되어 p53 과 상호작용 함으로써 세포 자가사멸이 저해됨.

 - 인간 전사인자인 FOXO4 의 DNA 결합 도메인 (FHD) 와 transactivation domain (TAD), DNA 와의 상호작용 규명 (Kim, J. et al., J. Mol. Biol. (2021))

- FOXO4 와 p53 간의 단백질 단백질 상호작용 규명 (Kim, J. et al, FEBS J. (2022))

Last updated 2024/01/01