デフォルトでターミナルの背景が水色で見にくいから、背景色とフォントカラーくらい変えたいと思ったら、次のアプリで設定できます。どこかに設定ファイルがあって、それを書き換えてもいいと思う。
Menu > ユーティリティ > Urxvt Terminal Control